| Revista: | Phyton |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000353417 |
| ISSN: | 0031-9457 |
| Autores: | Velázquez Sepúlveda, I1 Orozco Mosqueda, M.C1 Prieto Barajas, C.M1 Santoyo, G1 |
| Instituciones: | 1Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, Instituto de Investigaciones Químico-Biológicas, Morelia, Michoacán. México |
| Año: | 2012 |
| Volumen: | 81 |
| Paginación: | 81-87 |
| País: | Argentina |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental, aplicado |
| Resumen en español | El suelo rizosférico es uno de los reservorios más gran - des de la diversidad genética microbiana. Antes de realizar un estudio metagenómico a gran escala de un ambiente, tal como el suelo rizos - férico, es necesario realizar un análisis previo de la diversidad genética residente. Por ello, en este trabajo se detectó la diversidad bacteriana asociada a la rizósfera de plantas de trigo por medio de la amplifi - cación de PCR, construcción de una biblioteca y secuenciación de los genes 16S ribosomales. Se detectaron 30 OTUs, incluyendo las Clases Alfaproteobacteria, Betaproteobacteria, Deltaproteobacteria, Gammaproteobateria, Actinobacteria, Bacilli, Clostridia y bacterias no cultivables. Dentro de las Gammaproteobateria, los géneros más abundantes fueron Pseudomonas , Stenotrophomonas y Bacillus , ya que correspondieron al 40% del total de la biblioteca ribosomal completa. El análisis filogenético demostró que la mayoría de las secuencias ri - bosomales se agrupan en los clados que pertenecen a bacterias comu - nes del suelo o rizosféricas. Para determinar si la muestra es bastante diversa se llevó a cabo una prueba de Shannon-Wiener, resultando en una tasa de 3,8 bits por individuo. Nuestros resultados sugieren que la rizósfera de plantas de trigo es muy diversa y resulta un candidato excelente para otro tipo de análisis metagenómico |
| Resumen en inglés | Rhizospheric soil is one the largest reservoirs of micro - bial genetic diversity. Before conducting a large-scale metagenomic analysis of an environment, such as a rhizospheric soil, it is neces - sary to perform a pre-screening of the resident genetic diversity. In this study, we analyzed the bacterial diversity associated with the rhizosphere of wheat plants by PCR amplification, construction of a library and sequencing of 16S rDNA genes. Thirty OTUs were detected, including the Classes Alfaproteobacteria, Betaproteobac - teria, Deltaproteobacteria, Gammaproteobateria, Actinobacteria, Bacilli, Clostridia and Uncultivable bacteria. Within the Gamma - proteobacteria class, the genera Pseudomonas , Stenotrophomonas and Bacillus were the most abundant, since they corresponded to 40% of the whole ribosomal library. Phylogenetic analysis showed that most of the ribosomal sequences are grouped into clades that belong to common rhizospheric or bulk-soil bacteria. To determine whether the sample is significantly diverse, a Shannon-Wiener test was per - formed, resulting in a rate of 3.8 bits per individual. Our results sug - gest that the rhizosphere of wheat plants is highly diverse and results an excellent candidate for metagenomic analysis |
| Disciplinas: | Biología |
| Palabras clave: | Ecología, Fisiología vegetal, Trigo, Rizósfera, Diversidad bacteriana, Metanogénesis |
| Keyword: | Biology, Ecology, Plant physiology, Wheat, Rhizosphere, Bacterial diversity, Methanogenesis |
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