| Journal: | Acta Amazonica |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000446782 |
| ISSN: | 0044-5967 |
| Authors: | Mangaravite, Erica1 Terra, Vanessa2 Hattori, Eric Koiti Okiyama3 Dal’Sasso, Thaís Carolina da Silva1 Bhering, Leonardo Lopes4 Oliveira, Luiz Orlando de1 |
| Institutions: | 1Universidade Federal de Vicosa, Departamento de Bioquimica, Vicosa, Minas Gerais. Brasil 2Universidade Federal de Uberlandia, Instituto de Ciencias Agrarias, Monte Carmelo, Minas Gerais. Brasil 3Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, Instituto de Ciencias Agrarias, Unai, Minas Gerais. Brasil 4Universidade Federal de Vicosa, Departamento de Biologia Geral, Vicosa, Minas Gerais. Brasil |
| Year: | 2020 |
| Season: | Oct-Dic |
| Volumen: | 50 |
| Number: | 4 |
| Pages: | 335-338 |
| Country: | Brasil |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Aplicado, descriptivo |
| English abstract | Many tropical trees have high canopies and their leaves are not accessible. Thus, the use of tissue from a more accessible organ (cambium) for DNA extraction may be an alternative for molecular studies. We adapted a feasible methodology for extracting genomic DNA from cambium tissue harvested in the field for the assessment with PCR. We tested three storage conditions (two buffers and a silica gel) and four periods of time after harvest. We used previously described protocols and tested them on three species that occur in Amazonian forests and other biomes: Anadenanthera peregrina var. peregrina, Cedrela fissilis, and Ceiba speciosa. Our protocol obtained suitable PCR-grade genomic DNA for DNA sequencing and microsatellite genotyping. We recommend the use of silica for long-term storage and the buffer with ascorbic acid for short-term storage |
| Portuguese abstract | Muitas árvores tropicais possuem dossel alto e folhas não facilmente acessíveis. O uso de tecido de um órgão mais acessível (câmbio) para extração de DNA pode ser uma alternativa para estudos moleculares. Nós adaptamos uma metodologia viável para extrair DNA genômico de tecido cambial coletado no campo para avaliação com PCR. Testamos três condições de armazenamento (dois tampões e sílica gel) e quatro períodos após a coleta. Utilizamos protocolos descritos anteriormente e os testamos em três espécies encontradas em florestas amazônicas e outros biomas: Anadenanthera peregrina var. peregrina, Cedrela fissilis e Ceiba speciosa. Nosso protocolo foi eficaz na obtenção de DNA adequado para sequenciamento e genotipagem de microssatélites. Recomendamos o uso de sílica para armazenamento de longo prazo e o tampão com ácido ascórbico para curto prazo |
| Disciplines: | Biología |
| Keyword: | Botánica, Fisiología vegetal, Arboles, Extracción de ADN, Cambium |
| Keyword: | Botany, Plant physiology, Trees, DNA extraction, Cambium |
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