A feasible method to extract DNA from the cambium of high-canopy trees: from harvest to assessment



Título del documento: A feasible method to extract DNA from the cambium of high-canopy trees: from harvest to assessment
Revista: Acta Amazonica
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000446782
ISSN: 0044-5967
Autores: 1
2
3
1
4
1
Instituciones: 1Universidade Federal de Vicosa, Departamento de Bioquimica, Vicosa, Minas Gerais. Brasil
2Universidade Federal de Uberlandia, Instituto de Ciencias Agrarias, Monte Carmelo, Minas Gerais. Brasil
3Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, Instituto de Ciencias Agrarias, Unai, Minas Gerais. Brasil
4Universidade Federal de Vicosa, Departamento de Biologia Geral, Vicosa, Minas Gerais. Brasil
Año:
Periodo: Oct-Dic
Volumen: 50
Número: 4
Paginación: 335-338
País: Brasil
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Aplicado, descriptivo
Resumen en inglés Many tropical trees have high canopies and their leaves are not accessible. Thus, the use of tissue from a more accessible organ (cambium) for DNA extraction may be an alternative for molecular studies. We adapted a feasible methodology for extracting genomic DNA from cambium tissue harvested in the field for the assessment with PCR. We tested three storage conditions (two buffers and a silica gel) and four periods of time after harvest. We used previously described protocols and tested them on three species that occur in Amazonian forests and other biomes: Anadenanthera peregrina var. peregrina, Cedrela fissilis, and Ceiba speciosa. Our protocol obtained suitable PCR-grade genomic DNA for DNA sequencing and microsatellite genotyping. We recommend the use of silica for long-term storage and the buffer with ascorbic acid for short-term storage
Resumen en portugués Muitas árvores tropicais possuem dossel alto e folhas não facilmente acessíveis. O uso de tecido de um órgão mais acessível (câmbio) para extração de DNA pode ser uma alternativa para estudos moleculares. Nós adaptamos uma metodologia viável para extrair DNA genômico de tecido cambial coletado no campo para avaliação com PCR. Testamos três condições de armazenamento (dois tampões e sílica gel) e quatro períodos após a coleta. Utilizamos protocolos descritos anteriormente e os testamos em três espécies encontradas em florestas amazônicas e outros biomas: Anadenanthera peregrina var. peregrina, Cedrela fissilis e Ceiba speciosa. Nosso protocolo foi eficaz na obtenção de DNA adequado para sequenciamento e genotipagem de microssatélites. Recomendamos o uso de sílica para armazenamento de longo prazo e o tampão com ácido ascórbico para curto prazo
Disciplinas: Biología
Palabras clave: Botánica,
Fisiología vegetal,
Arboles,
Extracción de ADN,
Cambium
Keyword: Botany,
Plant physiology,
Trees,
DNA extraction,
Cambium
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