Statistical properties and linguistic coherence in noncoding DNA sequences



Título del documento: Statistical properties and linguistic coherence in noncoding DNA sequences
Revue: Revista mexicana de física E
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000343232
ISSN: 1870-3542
Autores: 1
2
Instituciones: 1Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Ciencias, México, Distrito Federal. México
2Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Química, México, Distrito Federal. México
Año:
Periodo: Dic
Volumen: 51
Número: 2
Paginación: 118-125
País: México
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental
Resumen en español Hasta hace poco tiempo exist´ıa la creencia general de que la gran mayor´ıa del ADN de organismos vivos (alrededor de un 95%) estaba constituido por lo que se ha dado en llamar ADN no codificante (NC-DNA, por sus siglas en ingl´es). No se conocen mecanismos de expresi´on para este NC-DNA, en contraste con lo que sucede con la expresi´on en forma de prote´ınas que posee el ADN codificante C-DNA. As´ı las cosas, el papel tradicional que se asignaba al NC-DNA era el de una protecci´on (sin funci´on biol´ogica propia) contra el ataque aleatorio de elementos mutag´enicos sobre el C-DNA. Sin embargo, algunos estudios comenzaron a realizarse sobre la naturaleza y funci´on biol´ogica del NC-DNA, estudios en cierto modo motivados por el descubrimiento de la estructura terciaria del c´odigo gen´etico. Algunas herramientas de la teor´ıa de multifractales y de la ling¨u´ıstica estad´ıstica han sido aplicados recientemente al an´alisis de coherencia y correlaci´on en fragmentos de ADN no codificante. Como resultado, se ha mostrado la presencia de correlaciones de largo alcance, patrones coherentes y a´un ciertas caracter´ısticas estructurales. Tal estructura y correlaci´on ser´ıan imposibles de hallarse en la secuencia aleatoria de nucle´otidos que se pensaba, constitu´ıa el NC-DNA
Resumen en inglés It has generally been thought that the vast majority of the DNA of living organisms (about 95%) was constituted of what is now called non-coding DNA (NC-DNA). No mechanisms of the genetic expression were known for this NC-DNA, as opposed to the protein expression for coding DNA (C-DNA). So NC-DNA was traditionally assigned a role as a cover-up (with no biological function of its own) against the random attack of mutagenic elements on the C-DNA. Nevertheless (and in some sense motivated by the discovery of the tertiary structure of the genetic code), studies into the nature and biological function of NC-DNA began. Some of the tools of multifractal theory and statistical linguistics were recently applied to the analysis of coherence and correlation in non-coding DNA fragments. As a result, the presence of long-range correlations, coherent patterns, and even some well defined structural features, showed up. This structure and correlation would be impossible to find in a random nucleotide sequence (as NC-DNA was originally thought to be constituted)
Disciplinas: Biología,
Matemáticas
Palabras clave: Genética,
ADN,
Genómica
Keyword: Biology,
Mathematics,
Genetics,
DNA,
Genomics
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