| Revista: | Bistua (Pamplona) |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000377070 |
| ISSN: | 0120-4211 |
| Autores: | Cancino Escalante, Giovanni Orlando1 Barbosa Hernández, Dámarys Sileidy1 Díaz Carvajal, Claudia1 |
| Instituciones: | 1Universidad de Pamplona, Departamento de Biología y Química, Pamplona, Norte de Santander. Colombia |
| Año: | 2012 |
| Volumen: | 10 |
| Número: | 1 |
| Paginación: | 80-89 |
| País: | Colombia |
| Idioma: | Español |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental, analítico |
| Resumen en español | Analizar las tasas de similitud y variabilidad genética entre las accesiones cultivadas elite y especies silvestres del genero Rubus con marcadores moleculares AFLP en fincas con cultivos comerciales de Rubus glaucus Benth, per tenecientes a cuatro asociaciones de cultivadores de mora en los municipios de Pamplona y Chitagá (Norte de Santander, Colombia). Se evaluaron individuos de 15 accesiones de R. glaucus que habían sido previamente seleccionados mediante mecanismos de selección participativa en fincas comerciales y tres especies silvestres (R.adenotrichus, R.bogotensis y R.rosifolius). Se emplearon 3 combinaciones de cebadores de AFLPs previamente reportados como polimórficos y reproducibles para Rubus, con el propósito de analizar el patrón molecular de las plantas de cada accesión seleccionada. Se efectuó un análisis de agrupamiento y un análisis de coordenadas principales con AFLP, que permitió agrupar las diferentes accesiones por su semejanza o disimilitud. Para el análisis de agrupamiento se utilizó el índice de similitud de Dice y el algoritmo de agrupamiento jerárquico UPGMA. Se contabilizaron 194 marcadores, 34,16% de los cuales fueron polimórficos. Estos resultados, alcanzados por primera vez en la región nororiental de Colombia (Provincia de Pamplona) en Rubus, son importantes ya que representan el primer estudio sobre el conocimiento de la diversidad genética de Rubus en la región de Pamplona. Adicionalmente se determino la huella genómica de genotipos elite de R. glaucus seleccionados por mecanismos de selección participativa, contribuyendo a los programas de mejoramiento genético de la mora de castilla y al manejo sostenible de la diversidad genética en Colombia y en la región Andina |
| Resumen en inglés | Analyze similarity rates and genetic variability between elite cultivated accessions and wild genus Rubus species with AFLP markers in commercial Rubus glaucus farms, owned by four blackberry growers association in the municipalities of Pamplona and Chitagá (Northeast of Santander, Colombia). Individuals of 15 previously selected accessions of R. glaucus and three wild species (R. adenotrichus, R. bogotensis y R. rosifolius), using participatory varietal selection were evaluated. Three combinations of AFLPs primers, previously reported as polymorphic and reproducible for Rubus, with the purpose of analyzing the plants molecular pattern of each accession were used. A conglomerate analysis was used to group the different accessions according to its similarity or dissimilarity. For the cluster analysis the samples were hierarchically grouped using the Dice coefficient (or similarity index) and the UPGMA methods. Of the 194 scored markers, 34.16% were polymorphic. These results are important because they represent the first study of the genetic diversity of Rubus in the nor th eastern region of Colombia (Province of Pamplona). In addition, the genomic fingerprint of elite R. glaucus genotypes using participatory varietal selection, contributes to the genetic improvement programs of blackberry and the sustainable management of genetic diversity in Colombia and the Andean Region |
| Resumen en portugués | Analisar as taxas de similaridade e variabilidade genética entre acessos e da elite de espécies cultivadas do gênero Rubus com marcadores moleculares AFLP em culturas fazendas de Rubus glaucus Benth, de quatro associações de produtores habita nos municípios de Pamplona e Chitagá (Nor te Santander, Colômbia). 15 indivíduos foram avaliados os acessos R. glaucus que havia sido previamente selecionados através de mecanismos participativos de seleção em fazendas comerciais e três espécies selvagens (R.adenotrichus, R.bogotensis e R.rosifolius ) foram usados para combinações de iniciadores AFLP como anteriormente relatados e reprodutíveis Rubus polimórficas, com a finalidade de analisar o padrão molecular das plantas selecionadas por adesão. Foi realizada uma análise de cluster e análise de coordenadas principais com AFLP, o que permitiu diferentes acessos agrupados por semelhança ou dissemelhança. Para a análise de agrupamento foi utilizado o índice de similaridade de Dice e UPGMA algoritmo de agrupamento hierárquico. 194 marcadores foram contados, 34,16% eram polimórficos. Estes resultados, obtidos pela primeira vez na região nordeste da Colômbia (Província de Pamplona) em Rubus, são impor tantes, pois representam o primeiro estudo sobre o conhecimento da diversidade genética de Rubus na região de Pamplona. Além disso, foi determinado os genótipos pegada genômicas de elite da R. glaucus selecionado mecanismos de seleção participativas que contribuam para os programas de melhoramento genético de padrão de amora e da gestão sustentável da diversidade genética na Colômbia e na região andina |
| Disciplinas: | Biología |
| Palabras clave: | Botánica, Genética, Rubus glaucus, Biología molecular, Especies silvestres, Especies cultivadas, Marcadores AFLP, Diversidad genética, Análisis de agrupamiento, Colombia |
| Keyword: | Biology, Botany, Genetics, Rubus glaucus, Molecular biology, Wild species, Cultured species, AFLP markers, Genetic diversity, Cluster analysis, Colombia |
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