| Journal: | Vaccimonitor (La Habana) |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000370718 |
| ISSN: | 1025-028X |
| Authors: | Isea, Raúl1 |
| Institutions: | 1Fundación Instituto de Estudios Avanzados, Baruta, Miranda. Venezuela |
| Year: | 2013 |
| Season: | Ene-Abr |
| Volumen: | 22 |
| Number: | 1 |
| Pages: | 43-46 |
| Country: | Cuba |
| Language: | Español |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Descriptivo |
| Spanish abstract | En la actualidad se estima que la mitad de la población humana puede contraer malaria y se carece de una vacuna en producción contra dicho flagelo, aunque las esperanzas están centradas en una llamada RTS,S/AS02. Es por ello que se debe continuar desarrollando metodologías computacionales que permitan el diseño racional de vacunas potencialmente efectivas. En ese sentido se propuso una nueva metodología computacional que predijera posibles epítopos consensos de células B lineales, presentes en el genoma del Plasmodium falciparum 3D7, a partir de la información disponible en la base de datos IEDB. Se descartaron aquellos que aparecían repetidos y se reagruparon en bloques, de acuerdo con los resultados obtenidos mediante los programas Redundancy y Nomad, respectivamente. Por último, se predijo su posible carácter antigénico con ayuda de los programas BepiPred, BcePred y BCPred. Por los resultados que se obtuvieron con esta metodología se destacaron tres secuencias potencialmente antigénicas de las 45 predichas, pero es imposible asegurar cuál de ellas es la más antigénica sin evidencia experimental |
| English abstract | Today it is estimated that half world population can be infected by malaria and there is not an available vaccine, however, there is hope with vaccine RTS,S/AS02. For this reason, we must continue to develop computer methodologies and strategies that will allow the rational design of potentially effective vaccines. We propose a new computational approach to predict linear B-cell epitopes from the whole genome sequencing of Plasmodium falciparum 3D7, obtained from IEDB database. Those that were repeated were discarded and were grouped into blocks according to the obtained results by Redundancy and Nomad programs. Subsequently, the possible antigenic character was predicted using the programs BepiPred, BcePred and BCPred. Three potentially antigenic sequences out of the 45 predicted were obtained with this methodology, but it is not possible to say which one the most antigenic without experimental evidence |
| Disciplines: | Medicina, Ciencias de la computación |
| Keyword: | Programación, Inmunología, Diseño, Vacunas, Epítopos, Células B, Paludismo, Plasmodium falciparum |
| Keyword: | Medicine, Computer science, Programming, Immunology, Design, Vaccines, Epitopes, B cells, Malaria, Plasmodium falciparum |
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