| Revista: | Universidad médica pinareña |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000441408 |
| ISSN: | 1990-7990 |
| Autores: | Iglesias Osores, Sebastián1 Tullume Vergara, Percy Omar2 Acosta Quiroz, Johana1 Saavedra Camacho, Johnny Leandro1 Rafael Heredia, Arturo3 |
| Instituciones: | 1Universidad Nacional Pedro Ruiz Gallo, Facultad de Ciencias Biológicas, Lambayeque. Perú 2Universidade de Sao Paulo, Instituto de Ciencias Biomedicas, Sao Paulo. Brasil 3Universidad Nacional de Ucayali, Facultad de Medicina Humana, Ucayali. Perú |
| Año: | 2020 |
| Periodo: | Sep-Dic |
| Volumen: | 16 |
| Número: | 3 |
| Paginación: | 555-555 |
| País: | Cuba |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Analítico, descriptivo |
| Resumen en español | Introducción: las epidemias virales han demostrado ser un riesgo para la salud humana, ya que pueden convertirse en pandemias y afectar a gran parte de la población, especialmente a los países pobres en vías de desarrollo. En este año 2020 la pandemia mundial por la COVID-19 está en marcha. Actualmente se están llevando a cabo investigaciones que muestran datos que combinan tanto la información genética como la social, las cuales pueden cambiar nuestra comprensión acerca de la dinámica de la epidemia. Objetivo: describir la herramienta tecnológica basada en la ciencia de datos, denominada Nextstrain, que permite visualizar las epidemias con los datos más actualizados en tiempo real, utilizando las bases de datos académicas. Desarrollo: actualmente hay secuencias virales de 57 países en 6 continentes. El antepasado común del virus que circula en el mundo surgió en Wuhan (China), a finales de 2019, y desde donde se supone que ha mutado hacia los seres humanos a partir de murciélagos y pangolines. En lo que respecta al seguimiento, se han realizado trabajos de investigación con este instrumento en países como Taiwán, Francia y Finlandia, que han podido determinar el lugar de origen de las cepas del SARS-CoV-2 que causan los brotes en sus respectivos países. Nextstrain permite compartir libremente los análisis filogenéticos de varios autores de diferentes países, así como analizar el amplio trabajo realizado sobre la epidemiología del virus. Conclusiones: Nextstrain es una herramienta creada a partir de grandes bases de datos que brinda una mejor visión acerca de patógenos de interés para la epidemiología mundial. Su uso se apoya en herramientas bioinformáticas y muestra esta información a través de un entorno agradable y comprensible |
| Resumen en inglés | Introduction: viral epidemics have presented a risk to human health since they can turn into pandemics and affect a large part of the population, especially for poor developing countries. In 2020, the worldwide pandemic of COVID-19 is underway. Research is currently being carried out showing data that combines genetic and social information that can change our understanding of the dynamics of the epidemic. Objective: to describe data science-based technology tool called Nextstrain that allows epidemics to be visualized with data as up to date as possible using academic databases. Development: there are currently viral sequences from 57 countries on 6 continents. The common ancestor of the virus circulating in the world emerged in Wuhan, China, in late November or early December 2019, and from where it is supposed to have mutated towards humans, from bats and pangolins. Regarding monitoring, research work is already being carried out using this tool, such as in Taiwan, France, and Finland, which were able to determine where the SARS-CoV-2 strains that were causing outbreaks in their respective country originated. Besides, Nextstrain allows to freely share the phylogenetic analyzes of various authors from different countries and allows us to see the great work in the epidemiology of the virus. Conclusions: Nextstrain is a tool based on big data that gives us a better view of the worldwide epidemiology of pathogens of interest. Its use is based on bioinformatic tools and it shows us this information through a pleasant and understandable ecosystem |
| Disciplinas: | Medicina |
| Palabras clave: | Genética, Virus, SARS-CoV-2, COVID-19, Análisis genómico, Bioinformática, Epidemiología |
| Keyword: | Genetics, Virus, SARS-CoV-2, COVID-19, Genomic analysis, Bioinformatics, Epidemiology |
| Texto completo: | http://www.revgaleno.sld.cu/index.php/ump/article/view/555/pdf |
