| Journal: | Semina. Ciencias biologicas e da saude |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000268643 |
| ISSN: | 1676-5435 |
| Authors: | Oliveira, Narjara do Carmo1 Rampazzo, Rita de Cassia Pontello Minari, Mariana Caldas Correa, Paulo Roberto Ceridorio Bizerra, Fernando Cesar Carneiro, Marcelo2 Svidzinski, Terezinha Inez Estivalet3 Maia, Luciana Furlaneto |
| Institutions: | 1Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciencias Biologicas, Londrina, Parana. Brasil 2Hospital Santa Cruz, Servico de Infectologia, Santa Cruz do Sul, Rio Grande do Sul. Brasil 3Universidade Estadual de Maringa, Centro de Ciencias da Saude, Maringa, Parana. Brasil |
| Year: | 2006 |
| Season: | Jul-Dic |
| Volumen: | 27 |
| Number: | 2 |
| Pages: | 125-132 |
| Country: | Brasil |
| Language: | Portugués |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, aplicado |
| English abstract | In this study, the chromogenic medium CHROMagar Candida™ and semi-nested PCR-based assay (sn- PCR) were compared in relation to their capacity to identify the species of 52 clinical isolates of Candida sp. By using the chromogenic medium, 39 (75%) yeasts isolates were presumptively identified as C. albicans (n = 22), C. glabrata (n = 9), C. tropicalis (n = 5) and C. krusei (n = 3). Thirteen isolates (25%) were not distinguishable to the species level. Through the sn-PCR, that is based on the ribosomal RNA genes (5.85 – 28S) cluster amplifications, 43 (83%) isolates were identified as C. albicans (n = 24), C. glabrata (n = 11), C. tropicalis (n = 5), C. parapsilosis (n = 3) and nine isolates could not be identified to the species level. Among the 52 analyzed isolates, 34 (65.4%) were in accordance with both methods, 12 (23.1%) showed discrepant results, and 6 (11.5%) could not be identified by any of the methodologies. The results indicate that both methods are limited, but the sn-PCR is more adequate than the chromogenic medium to identify species of the Candida genus, due to the lowest number of isolates that could not be identified |
| Portuguese abstract | Nesse trabalho, o meio cromogênico CHROMagar Candida e a técnica de semi-nested PCR (sn-PCR) foram comparados quanto a sua capacidade de identificar a espécie de 52 isolados clínicos de Candida sp. Com o emprego do meio cromogênico, 39 (75%) isolados foram identificados presuntivamente como C. albicans (n = 22), C. glabrata (n = 9), C. tropicalis (n = 5) e C. krusei (n = 3). Treze isolados (25%) não puderam ser identificados. Por meio da técnica de sn-PCR, que se baseia na amplificação de uma região do cluster gênico do RNA ribossomal (5.8S – 28S), 43 (83%) isolados foram identificados como C. albicans (n = 24), C. glabrata (n = 11), C. tropicalis (n = 5), C. parapsilosis (n = 3) e nove isolados não puderam ser identificados em nível de espécie. Entre os 52 isolados analisados, 34 (65,4%) apresentaram resultados concordantes pelos dois métodos, 12 (23,1%) apresentaram resultados discrepantes, e 6 (11,5%) não puderam ser identificadas por nenhuma das duas metodologias. Os resultados indicam que ambas as técnicas apresentam limitações, mas o método de sn-PCR é mais adequado que o meio cromogênico para a identificação de espécies do gênero Candida, devido ao menor número de isolados que não puderam ser identificados |
| Disciplines: | Medicina |
| Keyword: | Diagnóstico, Microbiología, Identificación bacteriana, Medios de cultivo, PCR, Candida |
| Keyword: | Medicine, Diagnosis, Microbiology, Bacterial identification, Culture media, PCR, Candida |
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