| Journal: | Revista mexicana de micología |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000318797 |
| ISSN: | 0187-3180 |
| Authors: | Winsett, Katherine E1 Stephenson, Steven L |
| Institutions: | 1University of Arkansas, Department of Biological Sciences, Fayetteville, Arkansas. Estados Unidos de América |
| Year: | 2008 |
| Season: | Dic |
| Volumen: | 27 |
| Pages: | 59-65 |
| Country: | México |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, aplicado |
| Spanish abstract | Un análisis de las secuencias del ITS de Didymium squamulosum, un mixomicete reconocido como cosmopolita, muestra variación entre aislamientos geográficamente separados. Los ITS 1 y 2, y la región que codifica para el ADNr de la subunidad 5.8S fueron amplificados a partir de especímenes recolectados en localidades ampliamente dispersas. Las secuencias fueron analizadas a través de un análisis de parsimonia. Los árboles resultantes muestran clados separados, de moderadamente a bien soportados, que agrupan a algunas, pero no a todas las procedencias geográficas. El ITS es el primer marcador molecular que se examina para variación intra-específica en mixomicetes, y aunque el análisis de las secuencias muestra diferencias estadísticamente significativas entre las secuencias de los 14 especímenes considerados, la heterogeneidad en el ITS 1 y en el ITS2 parece ser demasiado grande para esbozar cualquier conclusión biogeográfica significativa. La variación en la región 5.8S y la cantidad de variación encontrada en los ITS1 y 2 podría significar que los aislados examinados representan un complejo de especies gemelas, pero este marcador particular podría no ser útil para hacer esta distinción en este mixomicete |
| English abstract | An analysis of ITS sequences of Didymium squamulosum, a myxomycete regarded as cosmopolitan, shows variation among geographically separated isolates. ITS 1 and 2 and 5.8S rDNA were amplified from specimens collected in widely scattered localities. The sequences were analyzed by parsimony analysis and the resulting trees show separate, moderate and well supported clades grouping some, but not all, of the geographic locations. ITS is the first molecular marker examined for intraspecific variation in myxomycetes, and although sequence analysis shows statistically significant differences among sequences from the 14 specimens considered, the heterogeneity in ITS 1 and ITS 2 appears to be too great for any more meaningful biogeographical conclusions. Variation in the 5.8S and the amount of variation found in ITS 1 and 2 may signify that the isolates examined represent a complex of sibling species, although this particular marker cannot be used to make that distinction in this myxomycete |
| Disciplines: | Biología |
| Keyword: | Evolución y filogenia, Genética, Hongos, Secuencia génica, Relaciones genéticas, Variación intraespecífica, Didymium squamulosum, Myxomycetes |
| Keyword: | Biology, Evolution and phylogeny, Fungi, Genetics, Gene sequence, Genetic relationships, Intraspecific variation, Didymium squamulosum, Myxomycetes |
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