| Journal: | Revista mexicana de ciencias pecuarias |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000440256 |
| ISSN: | 2007-1124 |
| Authors: | Aguilar Trejo, Carlos Martín1 Luna Nevárez, Guillermo1 Reyna Granados, Javier Rolando1 Zamorano Algandar, Ricardo1 Romo Rubio, Javier Alonso2 Sánchez Castro, Miguel Ángel3 Mark Enns, R3 Speidel, Scott E3 Thomas, Milton G3 Luna Nevárez, Pablo1 |
| Institutions: | 1Instituto Tecnológico de Sonora, Departamento de Ciencias Agronómicas y Veterinarias, Ciudad Obregón, Sonora. México 2Universidad Autónoma de Sinaloa, Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia, Culiacán, Sinaloa. México 3Colorado State University, Department of Animal Sciences, Fort Collins, Colorado. Estados Unidos de América |
| Year: | 2020 |
| Season: | Jul-Sep |
| Volumen: | 11 |
| Number: | 3 |
| Pages: | 828-847 |
| Country: | México |
| Language: | Español, inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, analítico |
| Spanish abstract | El síndrome reproductivo y respiratorio porcino (PRRS) es una enfermedad viral que afecta el comportamiento reproductivo de las cerdas generando severas pérdidas económicas. El objetivo del presente estudio fue identificar polimorfismos de nucleótido simple (SNP) asociados al número de lechones nacidos vivos al primer (LNV1) y segundo parto (LNV2) en cerdas reproductoras expuestas al virus del PRRS. El estudio incluyó 100 cerdas gestantes de la línea Landrace(–)/Yorkshire(¼), de las cuales 75 fueron infectadas con el virus del PRRS y 25 permanecieron libres de PRRS. Muestras sanguíneas individuales (6 a 8 gotas) se depositaron en tarjetas FTA y posteriormente procesadas para la extracción de ADN, el cual fue genotipado usando un dispositivo para perfil genómico con 10,000 SNP. Los genotipos resultantes se analizaron usando un modelo mixto multi-locus, el cual detectó tres SNP asociados a LNV1 y cinco SNP asociados a LNV2 (P<0.001). Los ocho SNP fueron validados utilizando un modelo asociativo de efectos mixtos, que incluyó los términos genotipo y edad de la madre como efectos fijos, y el padre como efecto aleatorio. Los efectos de sustitución alélica se estimaron con el modelo anterior incluyendo el término genotipo como covariable. Los SNP rs81276080, rs81334603 y rs80947173 se asociaron a LNV1 (P<0.001), mientras que los SNP rs81364943, rs80859829, rs80895640, rs80893794 y rs81245908 se asociaron a LNV2 (P<0.001). Sólo dos SNP se ubican en regiones funcionales y el resto tiene posición intergénica. En conclusión, estos resultados sugieren la existencia de variantes génicas asociadas al desempeño reproductivo de cerdas infectadas por el virus del PRRS |
| English abstract | The porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) is a viral disease that decreases the reproductive performance in breeding sows and leads to economic losses to the swine industry. The objective of the present study was to identify single nucleotide polymorphisms (SNP) associated to the number of live-born piglets in the first (LBP1) and second birth (LBP2) in breeding sows exposed to PRRS virus. The study included 100 pregnant females of the Landrace(–)/ Yorkshire(¼) line, 75 of which were infected with the PRRS virus and 25 were free of PRRS. Individual blood samples (6-8 drops) were obtained and spotted onto FTA cards and subsequently processed for DNA extraction, which was genotyped using a 10,000 SNP chip for genomic profile. Resulting genotypes were analyzed using a multi-locus mixed model that detected three SNP associated to LBP1 and five SNP associated to LBP2 (P<0.001). These eight SNP were validated using an associative mixed effects model which included the terms genotype and age of dam as fixed effects, and sire as random effect. Allele substitution effects were estimated using the same model including the term genotype as covariate. The SNP rs81276080, rs81334603 and rs80947173 were associated to LBP1 (P<0.001), whereas the SNP rs81364943, rs80859829, rs80895640, rs80893794 and rs81245908 were associated to LBP2 (P<0.001). Only two SNP were in functional chromosomal regions and the remainder SNP were within an intergenic position. In conclusion, these results suggest the existence of gene variants associated with the reproductive performance of sows infected with the PRRS virus |
| Disciplines: | Medicina veterinaria y zootecnia, Biología |
| Keyword: | Virus, Porcinos, Genética, Reproducción, Alelos, Cerdas, Genotipos, Lechones, PRRS, SNP |
| Keyword: | Swine, Virus, Genetics, Reproduction, Alleles, Sows, Genotypes, Piglets, PRRS, SNP |
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