Genetic diversity analysis of the Mexican Lidia bovine breed population and its relation with the Spanish population by using a subset of SNPs under low gametic disequilibrium



Document title: Genetic diversity analysis of the Mexican Lidia bovine breed population and its relation with the Spanish population by using a subset of SNPs under low gametic disequilibrium
Journal: Revista mexicana de ciencias pecuarias
Database: PERIÓDICA
System number: 000434120
ISSN: 2007-1124
Authors: 1
2
2
2
Institutions: 1Universidad Autónoma de Barcelona, Barcelona. España
2Universidad Complutense de Madrid, Madrid. España
Year:
Season: Ene-Mar
Volumen: 9
Number: 1
Country: México
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Analítico, descriptivo
Spanish abstract El bovino de Lidia pertenece a una raza primitiva originada ≈250 años en la Península Ibérica, lugar donde aún se distribuye junto con diversos países de América. Seleccionados por un comportamiento que potencia la agresividad, estos bovinos fueron criados para participar en festividades populares que en la actualidad refuerzan la identidad de las culturas regionales. Diferentes festividades han demandado la selección de diferentes comportamientos, desencadenando una fragmentación de la raza en linajes. En México donde este ganado alcanzó gran popularidad, principalmente dos familias de criadores importaron de España bovinos a comienzos del siglo XX, especializando la producción. La diversidad genética y estructura de las poblaciones mexicanas y españolas han sido evaluadas con microsatélites, pero hoy en día los marcadores de tipo SNP permiten una mayor resolución. En este sentido se analizó la diversidad genética de la población mexicana de Lidia y se evaluó su relación con la española utilizando 573 SNPs con bajo desequilibrio de ligamiento (r2<0.01). En ambas poblaciones se observaron similares valores de diversidad genética. Valores significativos de F IS en ambas poblaciones significan una subdivisión de linajes, también se observaron mayores distancias genéticas F ST en la población española que en la mexicana. El análisis de estructura genética mostró similitud de tres linajes españoles con la familia González y algunos criadores de la familia Llaguno; pero la mayor parte de la familia Llaguno se agrupó separada: esta diferenciación así como la alta diversidad genética sugieren una introgresión de ganado criollo en la constitución de la población mexicana
English abstract Retaining features of the auroch (Bos taurus primigenius), the Lidia bovine is a primitive breed originated ~250 yr ago in the Iberian Peninsula, where is still distributed, along with France and several American countries. Selected upon a behavior, which enhances their aggressiveness; these bovines were raised to participate in popular festivities that nowadays reinforce the identity of regional cultures. Different festivities demanded diverse behavior patterns, prompting a fragmentation of the breed into small lineages. In Mexico, where these bovines reached high popularity, mainly two families of breeders imported Lidia bovines from Spain in the early XX century specializing their production either reproducing the new arrivals among them or realizing systematic crosses with local populations. Genetic diversity and structure of the Mexican and Spanish Lidia populations has been assessed with microsatellite data, but nowadays SNP molecular markers allows higher resolution level. Genetic diversity of the Mexican and Spanish Lidia populations and their relationship were assessed by using 573 SNPs with a low gametic disequilibrium (r2<0.01) from the 50K BeadChip on 468 individuals from both populations. In both populations, similar gene diversity values were observed. Significant F IS values in both populations means strong subdivision, higher F ST genetic distances were observed in the Spanish than in the Mexican population. Genetic structure analysis showed similarity of three Spanish lineages with González family and some Llaguno breeders, but most Llaguno family clustered separated: genetic differentiation along with high gene diversity suggest an introgression of creole cattle in the constitution of the Mexican population
Disciplines: Medicina veterinaria y zootecnia
Keyword: Bovinos,
Toros de lidia,
Comportamiento,
Estructura genética
Keyword: Bovines,
Fighting bulls,
Behavior,
Genetic structure
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