Rapid molecular diagnosis of tuberculosis and other mycobacteriosis in smear-negative clinical specimens



Document title: Rapid molecular diagnosis of tuberculosis and other mycobacteriosis in smear-negative clinical specimens
Journal: Revista de ciencias farmaceuticas basica e aplicada
Database: PERIÓDICA
System number: 000369181
ISSN: 1808-4532
Authors: 1
2
3
2
2
Institutions: 1Universidade Estadual Paulista "Julio de Mesquita Filho", Instituto de Quimica, Araraquara, Sao Paulo. Brasil
2Universidade Estadual Paulista "Julio de Mesquita Filho", Faculdade de Ciencias Farmaceuticas, Araraquara, Sao Paulo. Brasil
3Universidade de Sao Paulo, Faculdade de Ciencias Farmaceuticas, Sao Paulo. Brasil
Year:
Volumen: 27
Number: 2
Pages: 127-132
Country: Brasil
Language: Inglés
Document type: Artículo
Approach: Analítico, descriptivo
English abstract Delay in diagnosis of pulmonary and other forms of tuberculosis (TB) can be fatal, particularly in HIVinfected patients. Hence, techniques based on nucleic acid amplification, which are both rapid and of high specificity and sensitivity, are now widely used and recommended for laboratories that diagnose TB. In the present study, diagnostic methods based on mycobacterial DNA amplification were evaluated in comparative trials alongside tradicional bacterial methods, using negative smear samples from patients with clinically-suspected TB (sputum samples from 25 patients with suspected pulmonary TB, urine samples from two patients with suspected renal TB and cerebrospinal fluid samples from one patient with suspected meningeal TB). A specificity of 100% was achieved with DNA amplification methods and tradicional culture/identification methods, in relation to clinical findings and treatment results. For the smear-negative sputa, conventional PCR for M. tuberculosis was positive in 62% of suspected lung TB case, showing the same sensitivity as bacterial identification. Both techniques failed in the detection of extra-pulmonary samples. Nested PCR showed, after species-specific amplification, a sensitivity of 100%for M. avium and 85%for M. tuberculosis. For extra-pulmonary smear-negative samples, only Nested PCR detected M. tuberculosis and all cases were confirmed clinically. Nested PCR, in which two-step amplification reactions are performed, can identify the two most important mycobacteria in human pathology quickly and directly from clinical spicimens
Portuguese abstract Tradicionalmente, o diagnóstico laboratorial da tuberculose (TB), baseado na cultura da micobactéria, é um procedimento demorado, o que é um problema sério no caso de pacientes graves, mormente aqueles portadores de HIV. Por este motivo, técnicas de execução rápida, baseadas na amplificação de ácidos nucléicos, sensíveis e específicas, foram muito bem-vindas para o diagnóstico das micobacterioses e têm sido rapidamente assimiladas e utilizadas pelos laboratórios desta área. No presente estudo, métodos baseados na amplificação do ADN micobacteriano foram comparados entre si e com a metodologia tradicional. Foram estudados 28 pacientes Specimens/Mycobacteria Culture/identification PCR Nested PCR (total) Number % Number % Number % Sputum (25) Absence (07) M. tuberculosis (13) 8 61.5 8 61.5 11 84.6 M. avium (04) 4 100.0 0 … 4 100.0 M. chelonae (01) 1 … 0 … * * Urine (02) M. tuberculosis (02) 0 … 0 … 2 100.0 Cerebrospinal fluid (01) M. tuberculosis (01) 0 … 0 … 1 … * Detected in genus amplification (Figure 1) Table 1 - Mycobacteria identification by culture/identification, PCR and Nested PCR from smear-negative patients' specimens. com diagnóstico clínico de TB, porém com baciloscopia negativa (25 amostras de escarro, duas de urina e uma de liquor) e 55 controles normais (50 amostras de escarro e 5 de urina). Foi obtida uma especificidade de 100%, tanto para o método clássico quanto para os de amplificação de ADN. Para o caso dos pacientes portadores de TB pulmonar e com baciloscopia negativa no escarro, a cultura e a PCR convencional apresentaram, ambas, uma sensibilidade de 62% na detecção do Mycobacterium tuberculosis. Ambas falharam na demonstração deste agente nos casos de TB extra-pulmonar. Por outro lado, a técnica de Nested PCR, mediante uma amplificação específica para espécie, apresentou uma sensibilidade de 85% para o M. tuberculosis e de 100% para o M. avi
Disciplines: Medicina
Keyword: Diagnóstico,
Pruebas diagnósticas,
Diagnóstico molecular,
Frotis,
Mycobacterium tuberculosis,
Mycobacterium avium
Keyword: Medicine,
Diagnosis,
Diagnostic tests,
Molecular diagnosis,
Smear,
Mycobacterium tuberculosis,
Mycobacterium avium
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