| Journal: | Phyton |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000353426 |
| ISSN: | 0031-9457 |
| Authors: | Hernández León, R1 Martínez Trujillo, M2 Valencia Cantero, E1 Santoyo, G1 |
| Institutions: | 1Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, Instituto de Investigaciones Químico-Biológicas, Morelia, Michoacán. México 2Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, Facultad de Biología, Morelia, Michoacán. México |
| Year: | 2012 |
| Volumen: | 81 |
| Pages: | 133-137 |
| Country: | Argentina |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, aplicado |
| Spanish abstract | El suelo rizosférico de las plantas de trigo contiene una alta diversidad de microorganismos y por lo tanto, constituye una gran reserva para el descubrimiento de los genes con diversas aplicaciones de la biotecnología agrícola. En este trabajo, hemos construido una biblioteca metagenómica empleando como huésped heterólogo E. coli , clonando grandes fragmentos de ADN genómico en un cromosoma artificial bacteriano (BAC), proveniente de la rizósfera de plantas de trigo. El promedio de los segmentos de ADN clonado varió de 5 a 80 kb, con un tamaño promedio de 38 kb. Los extre - mos de varias clonas BAC, tomadas al azar fueron secuenciadas. Los resultados de homología de los BACs analizados mostraron princi - palmente funciones metabólicas y catalíticas (40%), incluyendo ami - dohidrolasas, hidrolasas, peptidasas, serina proteasas, endonucleasas y exonucleasas. Otra parte interesante de las clonas reveló secuencias genómicas con función hipotética (17%) o desconocida (9%). Las secuencias metagenómicas pertenecen en su mayoría a Firmicutes, Proteobacterias, Arqueas, Actinobacterias, hongos, virus, bacterias y taxones desconocidos sin clasificar. Se espera que la biblioteca meta - genómica del suelo rizosférico de las plantas de trigo siga creciendo. Al mismo tiempo, se están llevando a cabo análisis funcionales en la búsqueda de genes de interés agro-biotecnológico |
| English abstract | Rhizospheric soil of wheat plants contains a high di - versity of microorganisms, and therefore, comprises a large reservoir for discovering genes with diverse agro-biotechnological applica - tions. In this work, we constructed an E. coli metagenomic library based on bacterial artificial chromosome (BAC) clones with large genomic inserts from metagenomic DNA from the rhizosphere of wheat plants. The average of the DNA cloned segments varies from 5 to 80 kb, with an average size of 38 kb. Random clones were end-sequenced and homology results showed that the clonation of metagenomic DNA codes mainly for metabolic and catalytic func - tions (40%), including amidohydrolase, hydrolase, peptidase, serine protease, endonuclease and exonuclease. Another interesting pro - portion of the clones revealed genomic sequences with hypotheti - cal (17%) or unknown function (9%). The metagenomic sequences belonged mostly to Proteobacteria, Firmicutes, Archaea, Actino - bacteria, Fungi, Virus, Unclassified Bacteria and Unknown taxa. It is expected that the metagenomic library from rhizospheric soil of wheat plants keeps growing. At the same time, functional analyses are conducted in the search for genes of agrobiotech interest |
| Disciplines: | Biología, Agrociencias |
| Keyword: | Gramíneas, Biotecnología, Rizósfera, Trigo, Metagenómica |
| Keyword: | Biology, Agricultural sciences, Gramineae, Biotechnology, Rhizosphere, Wheat, Metagenomics |
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