Um protocolo de "nested-PCR" para detecção do vírus da anemia das galinhas



Document title: Um protocolo de "nested-PCR" para detecção do vírus da anemia das galinhas
Journal: Pesquisa veterinaria brasileira
Database: PERIÓDICA
System number: 000301617
ISSN: 0100-736X
Authors: 1
2

Institutions: 1Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Faculdade de Veterinaria, Porto Alegre, Rio Grande do Sul. Brasil
2Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Departamento de Biologia Molecular e Biotecnologia, Porto Alegre, Rio Grande do Sul. Brasil
Year:
Season: Abr-Jun
Volumen: 25
Number: 2
Pages: 106-110
Country: Brasil
Language: Portugués
Document type: Artículo
Approach: Experimental
English abstract This paper reports a nested polymerase chain reaction (nested-PCR) protocol for detection of chicken anemia virus (CAV), the causal agent of infectious chicken anemia. For DNA extraction from clinical samples, a method based on guanidine thiocyanate was found more sensitive and practical than other extraction protocols tested. The pair of primers used in the initial PCR targeted a 664 bp fragment on the VP1 gene. The primers for the internal PCR targeted a fragment of 520 bp. The specificity of the primers was evaluated on samples of CAV controlled flocks. Thirty different viruses and bacteria isolated from chickens did not give rise to any amplification product in the assay. The sensitivity of the nested-PCR was determined on serial dilutions of a CAV vaccine. The nested-PCR was more sensitive than a one step PCR and was able to detect at least 0.16 TCID50 of the vaccine strain. In addition, the protocol employed here detected viral DNA from tissues, sera and litter from flocks with or without clinical signs of disease. It is concluded that the nested-PCR protocol described here is more sensitive, faster and less cumbersome than virus isolation in cell culture as a diagnostic technique for detection of CAV
Portuguese abstract Este trabalho descreve o estabelecimento de um pro!tocolo de "nested-PCR" para a detecção do vírus da anemia das galinhas (CAV, chicken anemia virus), agente causador da anemia infecciosa das galinhas. Para a extração de DNA a partir de amostras clínicas um método baseado no uso de tiocianato de guanidina mostrou-se mais sensível e prático, do que os demais avaliados. Para a PCR inicial foi selecionado um par de primers que amplifica uma região de 664 pares de bases (pb) do gene VP1. Para a "nested-PCR" propriamente dita, foi selecionado um segundo par que amplifica uma região interna de 520 pb. A especificidade dos primers foi avaliada utilizando amostras de lotes controlados para CAV. Outras trinta amostras vírus e bactérias, causadoras de doenças em aves, não geraram produto de amplificação. A sensibilidade do teste foi determinada a partir de diluições seriadas de uma amostra vacinal de CAV. A "nested-PCR" mostrou ser mais sensível do que a PCR e foi capaz de detectar pelo menos 0,16 TCID50% da cepa vacinal. Além disso, detectou DNA viral em tecidos, soro e cama aviária de lotes com e sem sinais clínicos. Conclui-se que, como técnica para a detecção do CAV, o protocolo de "nested-PCR" aqui descrito, é mais sensível, rápido e menos trabalhoso do que o isolamento viral em cultivo celular
Disciplines: Medicina veterinaria y zootecnia,
Biología
Keyword: Aves de corral,
Medicina veterinaria,
Virus,
Anemia,
Nested-PCR,
Diagnóstico molecular
Keyword: Veterinary medicine and animal husbandry,
Biology,
Poultry,
Veterinary medicine,
Virus,
Molecular diagnosis
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