| Journal: | Journal of the Mexican Chemical Society |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000430054 |
| ISSN: | 1870-249X |
| Authors: | Silva Jiménez, Hortencia2 Araujo Palomares, Cynthia Lizzeth2 Macías Zamora, José Vinicio2 Ramírez Álvarez, Nancy2 García Lara, Bianey1 Corrales Escobosa, Alma Rosa1 |
| Institutions: | 1Universidad de Guanajuato, Departamento de Química, Guanajuato. México 2Universidad Autónoma de Baja California, Instituto de Investigaciones Oceanológicas, Ensenada, Baja California. México |
| Year: | 2018 |
| Season: | Abr-Jun |
| Volumen: | 62 |
| Number: | 2 |
| Country: | México |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, analítico |
| Spanish abstract | Una alternativa para remover los hidrocarburos aromáticos policíclicos (HAP) del ambiente es usando bacterias hidrocarbonoclastas. El objetivo de este trabajo fue estudiar la diversidad bacteriana de aislados nativos con potencial para degradar el pireno empleando al sistema MALDI-Biotyper (Bruker Daltonics) como una potente herramienta analítica de identificación y clasificación. Para ello, las bacterias fueron aisladas de muestras de agua superficial de mar y sedimento de tres sitios de la costa del Puerto de Rosarito, B.C., México. La concentración total de HAP en las muestras colectadas fue cuantificada por GC-MS, observándose valores en un rango de 0.461 - 0.525 ng mL-1 en agua de mar superficial y de 74 -266 ng g-1 en las muestras de sedimentos. Un total de 52 bacterias con capacidad de crecer en 25 mg L-1 de pireno como única fuente de carbono y energía fueron clasificados taxonómicamente por el sistema MALDI-Biotyper mediante la comparación de los espectros de masas con una librería y/o mediante la utilización de herramientas quimiométricas como Análisis de Componentes Principales (PCA; por sus siglas en inglés) y Coeficiente de Correlación de Concordancia (CCI; por sus siglas en inglés) para evaluar posibles diferencias a nivel de aislado. Los aislados identificados fueron representados por tres grandes grupos filogéneticos: Firmicutes, Actinobacteria y Proteobacteria. De estos aislados, las cepas del género de Kocuria parece ser excelentes candidatas continuar los estudios de degradación de HAP |
| English abstract | An alternative to remove polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) of the environment is using hydrocarbonoclastic bacteria. The aim of this work was to study the bacterial diversity of indigenous isolates with potential to degrade pyrene. We used MALDI-Biotyper (Bruker Daltonics) as a powerful analytical tool for identification. Bacteria were isolated from surface seawater and marine sediments samples of three sites from the coast of Rosarito Port, B.C., Mexico. Total concentration of PAHs in collected samples was quantified by GC-MS, showed values ranged 0.461-0.525 ng mL-1 and of 74 -266 ng g-1 in seawater and sediments samples, respectively. A total of 52 bacteria with capacity to grow in 25 mg L-1 pyrene as sole carbon and energy source were taxonomically identified and classified by MALDI-Biotyper system by comparing the mass spectra with library and/or to use chemometric tools as Principal Components Analysis (PCA) and Composite Correlation Index (CCI) to evaluate possible differences to isolate level. The identified isolates were represented by three phylogenetic groups: Firmicutes, Actinobacteria and Proteobacteria. Of these isolates, Kocuria strains appear to be excellent candidates to continue PAHs degradation studies |
| Disciplines: | Química, Biología |
| Keyword: | Bacterias, Química ambiental, Hidrocarburos aromáticos policíclicos (HAPs), Control biológico, Bacterias hidrocarbonoclastas, Análisis de componentes principales |
| Keyword: | Bacteria, Environmental chemistry, Biological control, Hydrocarbonoclastic bacteria, Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), Principal component analysis |
| Full text: | Texto completo (Ver HTML) Texto completo (Ver PDF) |
