Diferenciação de estirpes de Potato virus Y (PVY) por RT-PCR



Document title: Diferenciação de estirpes de Potato virus Y (PVY) por RT-PCR
Journal: Horticultura brasileira
Database: PERIÓDICA
System number: 000296281
ISSN: 0102-0536
Authors: 1
2
3
4
Institutions: 1Universidade Vale do Rio Doce, Governador Valadares, Minas Gerais. Brasil
2Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria, Hortalicas, Brasilia, Distrito Federal. Brasil
3Universidade Catolica de Brasilia, Brasilia, Distrito Federal. Brasil
4Agriculture and Agri-Food Canada, Potato Research Centre, Quebec. Canadá
Year:
Season: Oct-Dic
Volumen: 23
Number: 4
Pages: 904-910
Country: Brasil
Language: Portugués
Document type: Artículo
Approach: Experimental
English abstract The Potato virus Y (PVY) has become the major virus problem in seed potato growing areas of Brazil. Only necrotic and ordinary PVY strains were found infecting potatoes in Brazil. This situation drastically changed around 1997 when an epidemic of a PVY necrotic variant causing necrotic rings on the potato tuber surface was observed in the country. This study aimed to test the tuber necrotic strain differentiation method proposed by Weilguny & Singh (1998). Twenty eight PVY isolates originated from infected tubers and leaves from four Brazilian States were analyzed by host reaction after inoculation in tobacco, by ELISA using polyclonal antiserum and by the 3-primer RT-PCR method. The ordinary strain type isolates induced vein clearing and chlorotic pearl spots on Nicotiana tabacum leaves. All 24 remaining isolates inducing vein necrosis in leaves were classified as necrotic strains. All 28 PVY isolates positively reacted to PVY polyclonal antiserum by Elisa. Three RNA extraction methods were compared and the guanidine hydrochloride method was the most efficient and of the lowest cost. One isolate from Santa Catarina State and three from Rio Grande do Sul out of 28 PVY isolates submitted to RT-PCR method were differentiated as PVYº, confirming the biological test. One isolate of PVY N was detected from Santa Catarina and four from Rio Grande do Sul State. The PVY NTN was detected in Minas Gerais (six isolates), Santa Catarina (three isolates) and São Paulo (ten isolates). These results confirmed the presence of this new variant, PVY NTN in the main potato growing areas of Brazil
Portuguese abstract O Potato virus Y (PVY) tornou-se o maior problema nas áreas de produção de batata semente do Brasil. Somente as estirpes comum (PVYº) e necrótica (PVY N) eram detectadas infectando batata no Brasil. Esta situação mudou drasticamente a partir de 1997 quando um surto epidêmico de uma variante da estirpe necrótica de PVY causando arcos e anéis necróticos na superfície do tubérculo (PVY NTN) foi observado no país. Este estudo visou avaliar e validar uma metodologia de diferenciação de estirpes que causam necrose em tubérculos, proposta por Weilguny e Singh (1998). Vinte e oito isolados de PVY originários de tubérculos infectados de batata, provenientes de quatro estados brasileiros, foram analisados em sua reação em plantas de fumo, por Elisa, utilizando anti-soro policlonal e pelo método 3-primer RT-PCR. Quatro isolados induziram clareamento de nervuras e manchas peroladas em folhas de Nicotiana tabacum conforme esperado para a estirpe comum. Os 24 isolados restantes induziram necrose de nervuras neste hospedeiro portanto, classificados como da estirpe necrótica. Todos os 28 isolados de PVY reagiram positivamente contra o anti-soro policlonal de PVY por Elisa. Três métodos de extração de RNA foram testados, sendo que o método de hidrocloreto de guanidina mostrou-se o mais eficiente e de menor custo. Dos 28 isolados submetidos ao RT-PCR, um isolado de Santa Catarina e três do Rio Grande do Sul foram diferenciados como PVYº, confirmando os resultados do teste biológico. Um isolado de PVY N foi detectado no Estado de Santa Catarina e qua
Disciplines: Agrociencias
Keyword: Fitopatología,
Hortalizas,
Virus,
Potato virus Y (PVY),
Papa,
Solanum tuberosum,
RT-PCR,
Potyvirus
Keyword: Agricultural sciences,
Phytopathology,
Vegetables,
Virus,
Potato virus Y (PVY),
Potato,
Solanum tuberosum,
RT-PCR,
Potyvirus
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