| Journal: | Hidrobiológica (México D.F.) |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000460374 |
| ISSN: | 0188-8897 |
| Authors: | Pedroche, Francisco F1 |
| Institutions: | 1Universidad Autónoma Metropolitana, Departamento de Ciencias Ambientales, Lerma de Villada, Estado de México. México 2University of California, Herbario, Berkeley, California. Estados Unidos de América |
| Year: | 2021 |
| Season: | Sep-Dic |
| Volumen: | 31 |
| Number: | 3 |
| Pages: | 245-252 |
| Country: | México |
| Language: | Español |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, analítico |
| Spanish abstract | Antecedentes: Codium fragile es un alga verde que habita en las costas del Pacífico de Baja California, México, cuyos primeros registros datan de 1909. Esta especie que posee varias subespecies, una de ellas Codium fragile subsp. fragile, oriunda de Japón, ha demostrado ser un organismo invasor en diferentes partes del mundo. Objetivos: Confirmar la presencia o ausencia de esta cepa invasora en las costas del Pacífico mexicano, comparando individuos de Japón, Estados Unidos y México mediante el uso de herramientas moleculares. Métodos: Se analizaron 20 individuos de las especies registradas para el Pacífico mexicano y diez fuera de la región, incluyendo además dos como grupo externo. El DNA genómico se extrajo mediante el método Sanger, se amplificaron regiones de los marcadores psb y 23S, las secuencias obtenidas se editaron y alinearon en MEGA y MESQUITE, posteriormente se realizaron análisis filogenéticos de máxima verosimilitud en PAUP y MEGA y de inferencia bayesiana en MrBayes. Las distancias genéticas se obtuvieron en MEGA y PAUP. Resultados: Se demuestra que, genéticamente, los individuos de México integran un clado diferente a la entidad asiática, con distancias genéticas inter-especie que se ubicaron en 6% para el marcador 23S, mientras que para los subclados de C. fragile la distancia entre ellos fue de 0.4%. Para psb, la distancia fue del 25% entre especies y de 2.2% entre estas dos subespecies. Conclusiones: Individuos de California y México se anidaron en el clado nativo C. fragile, mientras que otros procedentes también de California se reconocen con el de Japón como pertenecientes al clado invasor (C. fragile subsp. fragile); así por el momento, se confirma la ausencia de esta cepa invasora en el Pacífico de México |
| English abstract | Background: Codium fragile is a green alga that inhabits the Pacific coast of Baja California, Mexico, whose first records date back to 1909. This species has several subspecies, one of them Codium fragile subsp. fragile, originally from Japan, has proven to be an invasive organism in different parts of the world. Objectives: Confirm the presence or absence of this invasive strain on the coast of the Mexican Pacific, comparing with individuals from Japan, the United States and Mexico using molecular tools. Methods: We analyzed 20 individuals of the different species recorded for the Mexican Pacific and ten outside the region, including two as outgroup. The genomic DNA was extracted using the Sanger method, regions of the psb and 23S markers were amplified, the sequences obtained were edited and aligned in MEGA and MESQUITE, subsequently phylogenetic analyses of maximum likelihood were carried out in PAUP and MEGA and Bayesian inference in MrBayes. Genetic distances were obtained in MEGA and PAUP. Results: It is shown that, genetically, the individuals from Mexico integrate a clade different from the Asian entity, with inter-species genetic distances that were located at 6% for the 23S marker, while for the subclades of C. fragile the distance between them was 0.4%. For psb, the distance was 25% between species and 2.2% between these two subspecies. Conclusions: Individuals from California and Mexico nested in the native clade C. fragile, while others also from California are recognized with that of Japan as belonging to the invasive clade (C. fragile subsp. fragile). At the moment, the absence of this invasive strain in the Pacific of Mexico is confirmed |
| Disciplines: | Biología |
| Keyword: | Algas, Codium giraffa, Chlorophyta, Océano Pacífico, México, Algas marinas, Baja California, Especies nativas, Especies invasoras, ADN, Cloroplastos |
| Keyword: | Algae, Codium giraffa, Chlorophyta, Pacific Ocean, Mexico, Marine algae, Baja California, Chloroplasts, DNA, Invasive species, Native species |
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