Caracterización de las comunidades microbianas asociadas a un florecimiento cianoalgal en una presa de León, Gto. México mediante secuenciación de regiones variables de los genes que codifican la rARN 16S y 18S



Document title: Caracterización de las comunidades microbianas asociadas a un florecimiento cianoalgal en una presa de León, Gto. México mediante secuenciación de regiones variables de los genes que codifican la rARN 16S y 18S
Journal: Hidrobiológica (México D.F.)
Database: PERIÓDICA
System number: 000460513
ISSN: 0188-8897
Authors: 1
2
1
Institutions: 1Instituto Tecnológico Superior de Irapuato, Irapuato. México
2Instituto Politécnico Nacional, Centro de Investigación y Estudios Avanzados, Irapuato. México
Year:
Season: Ene-Abr
Volumen: 31
Number: 1
Pages: 93-105
Country: México
Language: Español
Document type: Artículo
Approach: Experimental, analítico
Spanish abstract Antecedentes: Los florecimientos algales son cada vez más frecuentes como consecuencia de las actividades humanas, incluyendo el cambio climático. El análisis de la diversidad microbiana durante estos eventos proporciona información de cómo estas alteraciones están modificando el ecosistema. Estudios con un enfoque molecular, basados en metagenómica, ofrecen una visión de la dinámica de las comunidades microbianas cultivables y no cultivables presentes durante el florecimiento. Objetivo: Determinar la diversidad microbiana: la riqueza de especies y su abundancia en la presa “El Palote” León, Gto. que presenta florecimientos microalgales. Métodos: Las comunidades procariotas y eucariotas en la superficie y a dos metros de profundidad se analizaron por metagenómica con los genes que codifican las subunidades ribosomales 16 y 18S, para las comunidades microbianas procariotas y eucariotas, respectivamente. Resultados: El análisis taxonómico de biodiversidad medida por el índice Shannon, mostró patrones de distribución similares en la muestra tomada en la superficie y a dos metros de profundidad, mientras que, con el índice Simpson mostró diferencias. Los filos dominantes de los microorganismos procariotes fueron Cianobacterias del género Planktothrix spp, (69%, 2 m y 67%, 0 m), Proteobacterias (13.7 y 13%) y Bacteriodetes (6 y 8.2%). En el caso de los eucariotes, los grupos dominantes fueron Opisthokonta y Stramenopila, Alveolata y Rhizaria (SAR). El análisis por cuantiles reveló diferencias de abundancia: Flavobacterium spp. Aeromonas rivuli-sobria, Rheinheimera spp., Cetobacterium somerae y Cryptomonas curvata estuvieron presentes mayormente a dos metros de profundidad, mientras que Methylocaldum szegediense, Pseudospirillum y Aeromonas sobria estuvieron en mayor abundancia en la superficie. Conclusiones: Los resultados presentan un panorama de la estructura de las comunidades microbianas asociadas a un florecimiento algal de
English abstract Background: Algal blooms have become more frequent due to human activity, including climate change. Analyzing of microbial diversity during the events provides information of how disturbances are shaping ecosystem. Metagenome-based analysis provides a molecular approach that gives an overview of the dynamic of the cultivable and uncultivable microbial communities during the bloom. Goals: Our goal was to determine the microbial diversity: the species richness, and their abundance in the dam “El Palote” León, Gto. that presented algal bloom. Methods: Prokaryotic and eukaryotic microbial community composition was analyzed by 16S and 18S rRNA amplification and sequencing. Results: Biodiversity taxonomic analysis was measured by Shannon index showed similar distribution patterns between samples taken at surface and two-meter depth, while Simpson index presented differences. The prokaryotic dominant phyla were cyanobacteria of Planktothrix genera (67%, 0 m and 69%, 2 m), Proteobacteria (13.7 and 13%) and Bacteriodetes (6 and 8.2%). Regarding eukaryotes the dominant groups were Opisthokonta as well as Stramenopila, Alveolata and Rhizaria (SAR). Quantile based analysis showed relative abundance differences Flavobacterium spp. Aeromonas spp., Rheinheimera spp., Cetobacterium somerae and Cryptomonas curvata were majority at two meters depth, while Methylocaldum szegediense, Pseudospirillum and Aeromonas sobria presented high abundance at the surface. Conclusions: The results showed an overview of microbial communities asociated with a cianoalgal bloom dominated by Planktothrix agardhii-rubescens
Disciplines: Biología
Keyword: Genética,
Biología acuática,
Análisis taxonómico,
Guanajuato,
México,
Diversidad microbiana,
Cianobacterias,
Metagenómica,
ARN ribosomal
Keyword: Genetics,
Aquatic biology,
Taxonomic analysis,
Guanajuato,
Mexico,
Ribosomal RNA,
Cyanobacteria,
Microbial diversity,
Metagenomics
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