Identificación genética y análisis filogenético de cíclidos del estado de Tamaulipas mediante la secuenciación del Citocromo B mitocondrial



Document title: Identificación genética y análisis filogenético de cíclidos del estado de Tamaulipas mediante la secuenciación del Citocromo B mitocondrial
Journal: Ecosistemas y recursos agropecuarios
Database: PERIÓDICA
System number: 000446911
ISSN: 2007-9028
Authors: 1
2
1
2
2
2
3
2
Institutions: 1Universidad Tecnológica del Mar de Tamaulipas Bicentenario, Soto la Marina, Tamaulipas. México
2Instituto Politécnico Nacional, Centro de Biotecnología Genómica, Reynosa, Tamaulipas. México
3Universidad Autónoma de Nuevo León, Facultad de Ciencias Biológicas, San Nicolás de los Garza, Nuevo León. México
Year:
Volumen: 7
Number: 3
Country: México
Language: Español
Document type: Nota breve o noticia
Approach: Experimental, analítico
Spanish abstract . El objetivo del presente estudio fue verificar genéticamente la identidad de especies del genero Herichthys y estudiar su relación fiolgenética utilizando secuencias de citocromo B mitocondrial. Se incluyeron muestras de dos sitios de Tamaulipas de dicha especie: en el río Panal ubicado en Playa Tepehuajes, Soto la Marina y en el río Carrizal ubicado en Aldama. Se analizaron las secuencias completas del gen mitocondrial citocromo B con herramientas bioinformáticas, los resultados de similitud genética indican que las muestras de Aldama tienen mayor similitud (> 99%) con la especie Herichthys carpintis. Mientras que las muestras de Tepehuajes, confirmaron la identidad supuesta con Herichthys cyanoguttatus. Los árboles filogenéticos analizados con la finalidad de comparar la distancia genética de las muestras con diferentes especies de cíclidos, confirmaron la similitud encontrada previamente. Los resultados sugieren que el citocromo B es un marcador útil en la identificación de especies de cíclidos de Tamaulipas
English abstract . The aim of the present work was to perform a genetic verification of Herichthys species and assess their phylogenetic relationship by Cytochrome B gene resequencing in two sampling sites from Tamaulipas. Samples from Panal river in Playa Tepehuajes, Soto la Marina and samples from Carrizal river in Aldama were included. The complete sequences were analyzed with bioinformatics tools and the genetic similarity showed that Aldama samples resembled Herichthys carpintis species (> 99%) and Tepehuajes samples were confirmed as Herichthys cyanoguttatus. The assessed phylogenetic trees for genetic distance comparison among current samples and other cichlids species support the previously found results. This study suggest that cytochrome B gene is useful for genetic identification of cichlid species, such as from Tamaulipas
Disciplines: Biología
Keyword: Peces,
Genética,
ADN mitocondrial,
Herichthys carpintis,
Herichthys cyanoguttatus,
Secuenciación génica,
Similitud genética
Keyword: Fish,
Genetics,
Gene sequencing,
Genetic similarity,
Herichthys carpintis,
Herichthys cyanoguttatus,
Mitochondrial DNA
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