| Journal: | Computación y sistemas |
| Database: | |
| System number: | 000560142 |
| ISSN: | 1405-5546 |
| Authors: | Hernández Montiel, Luis Alberto1 León Borges, José Antonio2 Huerta Hernández, Luis David1 |
| Institutions: | 1Universidad del Istmo, Ciudad Ixtepec. México 2Universidad de Quintana Roo, Cancún. México |
| Year: | 2018 |
| Season: | Abr-Jun |
| Volumen: | 22 |
| Number: | 2 |
| Pages: | 585-597 |
| Country: | México |
| Language: | Español |
| Document type: | Artículo |
| Spanish abstract | En este artículo, se presenta un método híbrido basado en técnicas de minería de datos y una búsqueda tabú aplicado en la selección y clasificación de genes de Microarreglos de ADN. El método está dividido en dos etapas, en la primera etapa se elimina toda la información no relevante de la base de datos utilizando cinco técnicas de filtrado de datos. Con los subconjuntos de genes obtenidos por esta etapa, se realiza una nueva etapa de selección de genes utilizando una búsqueda tabú, para el proceso de clasificación de los genes seleccionados, se utilizan los clasificadores SVM, LDA, KNN por separado. El método se ha implementado para obtener un subconjunto pequeño de genes de alto desempeño, los resultados obtenidos se comparan con otros métodos reportados en la literatura, este método se aplica en tres bases de datos de dominio público. |
| English abstract | Abtract: In this article, we present a hybrid method based on data mining techniques and a taboo search applied in the selection and classification of DNA Microarray genes. The method is divided into two stages, in the first stage all non-relevant information in the database is eliminated using five data filtering techniques. With the subsets of genes obtained by this step, a new stage of gene selection is carried out using a taboo search, for the classification process of the selected genes, the SVM, LDA, KNN classifiers are used separately. The method has been implemented to obtain a small subset of high performance genes, the results obtained are compared with other methods reported in the literature, this method is applied in three databases of public domain. |
| Disciplines: | Ciencias de la computación |
| Keyword: | Microarreglos de ADN, Normalización, Filtrado de datos, Selección, Clasificación, Búsqueda local, Procesamiento de datos |
| Keyword: | DNA microarrays, Normalization, Data filtering, Selection, Classification, Local search, Data processing |
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