| Journal: | Brazilian journal of plant physiology |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000276161 |
| ISSN: | 1677-0420 |
| Authors: | Dornelas, Marcelo Carnier1 Dornelas, Marcelo Carnier2 Rodriguez, Adriana Pinheiro Martinelli |
| Institutions: | 1Universidade de Sao Paulo, Centro de Energia Nuclear na Agricultura, Piracicaba, Sao Paulo. Brasil 2Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, Sao Paulo. Brasil |
| Year: | 2005 |
| Season: | Abr-Jun |
| Volumen: | 17 |
| Number: | 2 |
| Pages: | 255-266 |
| Country: | Brasil |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, analítico |
| English abstract | Flowering initiation depends on the balanced expression of a complex network of genes that is regulated by both endogenous and environmental factors. The timing of the initiation of flowering is crucial for the reproductive success of plants; therefore, they have developed conserved molecular mechanisms to integrate both environmental and endogenous cues to regulate flowering time precisely. Extensive advances in plant biology are possible now that the complete genome sequences of flowering plants is available and plant genomes can be comprehensively compared. Thus, association studies are emerging as powerful tools for the functional identification of genes involved on the regulation of flowering pathways. In this paper we report the results of our search in the Eucalyptus Genome Sequencing Project Consortium (FORESTS) database for expressed sequence tags (ESTs) showing sequence homology with known elements of flowering-time pathways. We have searched the 33,080 sequence clusters in the FORESTS database and identified Eucalyptus sequences that codify putative conserved elements of the autonomous, vernalization-, photoperiod response- and gibberellic acid-controlled flowering-time pathways. Additionally, we have characterized in silico ten putative members of the Eucalyptus homologs to the Arabidopsis CONSTANS family of transcription factors |
| Portuguese abstract | As decisões envolvidas na iniciação do processo de florescimento dependem da expressão equilibrada de uma rede complexa de genes, que é regulada por fatores endógenos e ambientais. A regulação correta da transição para o florescimento é crucial para o sucesso reprodutivo das plantas; dessa forma elas desenvolveram mecanismos moleculares conservados para integrar tanto indícios ambientais como endógenos para regular precisamente o tempo do florescimento. Avanços recentes na biologia molecular vegetal, incluindo o seqüenciamento completo de genomas, tornaram possível a comparação detalhada de genomas vegetais. Assim, estudos comparativos de genômica funcional estão emergindo como ferramentas poderosas para a identificação de genes envolvidos no regulamento das vias metabólicas relacionadas ao florescimento. Neste artigo são apresentados resultados da busca no banco de dados do Projeto FORESTS (Eucalyptus Genome Sequencing Project Consortium) para a obtenção de etiquetas de seqüências expressas (ESTs) mostrando homologia com elementos-chave das vias reguladoras do florescimento. Os 33.080 ¨clusters¨ de ESTs de Eucalyptus spp. disponíveis no banco de dados do FORESTS foram analisados, e identificaram-se elementos conservados, possivelmente envolvidos nas vias controladoras do florescimento, quer sejam as autônomas, quer as controladas por vernalização, por ácido giberélico ou por fotoperíodo. Adicionalmente, foram caracterizados in silico dez possíveis membros da família CONSTANS de fatores de transcrição de Arabidopsis, em Eucalyptus |
| Disciplines: | Biología |
| Keyword: | Fisiología vegetal, Biotecnología, Vernalización, Arabidopsis, Eucalyptus, Floración, Fotoperíodo, Expresión génica |
| Keyword: | Biology, Plant physiology, Photoperiod, Vernalization, Arabidopsis, Eucalyptus, Flowering, Gene expression |
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