| Revista: | Botanical Sciences |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000453934 |
| ISSN: | 2007-4298 |
| Autores: | Maya Lastra, Carlos Alonso1 Alvarado Cárdenas, Leonardo O2 Rodríguez Gómez, Flor del Carmen3 Urrea Galeano, Lina Adonay4 Villaseñor, José Luis5 Ruiz Sanchez, Eduardo6 |
| Instituciones: | 1Columbia University, Department of Ecology, Evolution, and Environmental Biology, Nueva York. Estados Unidos de América 2Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Ciencias, Ciudad de México. México 3Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de Ciencias Exactas e Ingenierías, Guadalajara, Jalisco. México 4Universidad Nacional Autónoma de México, Instituto de Ecología, Ciudad de México. México 5Universidad Nacional Autónoma de México, Instituto de Biología, Ciudad de México. México 6Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias, Zapopan, Jalisco. México |
| Año: | 2022 |
| Volumen: | 100 |
| Paginación: | 66-82 |
| País: | México |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Analítico, descriptivo |
| Resumen en español | México tiene alrededor de 23,300 especies de plantas vasculares, la mitad de ellas endémicas, y es el tercer país en riqueza de especies del continente americano. La riqueza se puede entender a través de listados y floras y las relaciones evolutivas. El listado de especies y los metadatos de las secuencias depositadas en GenBank pueden ayudarnos a determinar el grado de representación de la flora vascular de México, considerando estudios taxonómicos y sistemáticos. Formulamos ocho preguntas relacionadas con aspectos biológicos, indicadores bibliométricos, métodos y marcadores utilizados en estudios filogenéticos con especies distribuidas en México. Se extrajeron los metadatos de GenBank utilizando Datataxa y la lista de especies vasculares de México publicadas en taxonomía y sistemática. La selección, filtrado y estadísticos se obtuvieron con scripts creados para este trabajo. Un total de 12,589 especies tienen registro de secuencias en GenBank, publicadas en 3,807 artículos. La revista Systematic Botany tiene más de 400 publicaciones. El número de autores varió entre 1 y 6. El factor de impacto promedio fue de 1.64. Magnoliophyta, Poales y Poaceae son las categorías taxonómicas con más artículos publicados. Parsimonia e ITS son el método y el marcador más utilizados, respectivamente. Analizamos la importancia de México como repositorio biológico para comprender la evolución de las plantas en la ciencia global. Este es el primer estudio sobre la importancia que tiene la flora de un país en los trabajos filogenéticos. Falta muestrear numerosos grupos, pero principalmente las especies endémicas que pueden contribuir a resolver diferentes linajes en la filogenia |
| Resumen en inglés | Mexico has over 23,300 vascular plant species, half of which are endemic, and ranks third in species richness in the Americas. Compiling checklists and floras, and examining phylogenetic relationships are the ways we develop a better understanding of species richness. The plant checklist and the metadata of the sequences in GenBank can help determine how well represented Mexico’s vascular flora is, using the taxonomic and systematic studies done in Mexico and internationally. We formulated eight questions related to biological aspects, bibliometric indicators, methods, and the markers used in phylogenetic studies for species distributed in Mexico. The list of Mexico’s vascular species published in taxonomy and systematics articles was used to extract GenBank’s metadata using Datataxa. The selection, filtering, and descriptive statistics were obtained with scripts designed for this study. We found that 12,589 species have sequence records in GenBank, published in 3,807 articles. The journal Systematic Botany has more than 400 publications. The number of authors ranges from 1 to 6. Average impact factor was 1.64. Magnoliophyta, Poales, and Poaceae have the highest number of published articles. Parsimony and ITS are the most widely used method and marker, respectively. We explore the importance of Mexico as a biological repository for understanding the evolution of plants in global science. This is the first study on the importance of a country’s flora in phylogenetic work. Numerous groups and endemic species lack sequencing data that could contribute to the resolution of different lineages in the phylogeny |
| Disciplinas: | Biología, Bibliotecología y ciencia de la información |
| Palabras clave: | Fuentes documentales, Botánica, Taxonomía y sistemática, México, Plantas vasculares, Metadatos, Factor de impacto, Listado florístico, Marcadores moleculares, Filogenia |
| Keyword: | Floristic checklist, Information sources, Botany, Taxonomy and systematics, Mexico, Vascular plants, Metadata, Impact factor, Molecular markers, Phylogeny |
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