| Journal: | Botanical Sciences |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000446940 |
| ISSN: | 2007-4298 |
| Authors: | Mao, Lihui1 Liu, Jianxin1 Ding, Huaqiao1 Zou, Qingcheng1 Tian, Danqing1 |
| Institutions: | 1Zhejiang Institute of Landscape Plants and Flowers, Hangzhou, Zhejiang. China |
| Year: | 2021 |
| Season: | Ene-Mar |
| Volumen: | 99 |
| Number: | 1 |
| Pages: | 124-131 |
| Country: | México |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Analítico, descriptivo |
| Spanish abstract | Antecedentes: Curcuma alismatifolia es un cultivar ornamental con muchas varias variedades introducidas en China desde Tailandia en los últimos quince años. C. alismatifolia se usa como flor cortada, flor en maceta o para hacer ramilletes de flores. Preguntas y/o Hipótesis: Se dispone de información genética y genómica limitada para esta especie, lo que impide estudios sobre el aumento de su valor ornamental y la resistencia al estrés. Especies estudiadas: Curcuma alismatifolia Lugar de estudio y fechas: Zhejiang, 2018 Métodos: Tecnología de secuenciación unicelular de PCR y electroforesis en gel de poliacrilamida. Resultados: (A/T)n representó el 43.6 % de los SSR, la proporción máxima, y las repeticiones de mononucleótidos y trinucleótidos fueron los dos tipos de repeticiones más abundantes. Se diseñaron con éxito un total de 3,637 pares de cebadores que flanquean las secuencias de SSR y se seleccionaron al azar 70 conjuntos de cebadores para su validación en 10 variedades. 41 (59 %) de los 70 pares de cebadores amplificaron con éxito los alelos, de los cuales 35 se identificaron como marcadores polimórficos y se utilizaron para evaluar el nivel de diversidad genética y las relaciones genéticas entre las 10 variedades. El análisis de diversidad genética mostró que el número de alelos (Na) en cada locus varió de 2 a 8, con un promedio de 3.97, y que el PIC tenía una media de 0.524 y osciló entre 0.095 y 0.795. Conclusiones: La distancia genética entre las 10 variedades varió de 0.30 a 0.96 y en el dendrograma variedades forman tres grupos |
| English abstract | Background: Curcuma alismatifolia is an ornamental cultivar with several varieties introduced into China from Thailand within the past fifteen years. Curcuma alismatifolia is widely used as cut flowers and potted flowers and is also used in flower beds. Questions and/or Hypotheses: However, limited genetic and genomic information is available for this species, which has impeded studies on the enhancement of its ornamental value and stress resistance. Studied species Curcuma alismatifolia Study site and dates: Zhejiang, 2018 Methods: single-cell sequencing technology of PCR and polyacrylamide gel electrophoresis Results: (A/T)n accounted for 43.6 % of the SSRs, the maximum proportion, and mononucleotide and trinucleotide repeats were the two most abundant repeat types. A total of 3,637 primer pairs flanking SSR sequences were successfully designed, and 70 sets of primers were randomly selected for validation in 10 varieties. Forty-one (59 %) of the 70 primer pairs successfully amplified alleles, of which 35 were identified as polymorphic markers and used to assess the level of genetic diversity and genetic relationships among the 10 varieties. The genetic diversity analysis showed that the number of alleles (Na) at each locus ranged from 2 to 8, with an average of 3.97, and that PIC had a mean of 0.524 and ranged from 0.095 to 0.795. Conclusions: The genetic distance between 10 varieties varied from 0.30 to 0.96, and the dendrogram clustered all varieties into three groups |
| Disciplines: | Biología |
| Keyword: | Genética, Plantas ornamentales, Marcadores genéticos, Diversidad genética, Primers, ARN mensajero, Secuencia génica, Curcuma alismatifolia, Zingiberaceae |
| Keyword: | Genetics, Ornamental plants, Genetic markers, Genetic diversity, Primers, Messenger RNA, Gene sequence, Curcuma alismatifolia, Zingiberaceae |
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