| Revista: | Biotecnología aplicada |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000349796 |
| ISSN: | 0864-4551 |
| Autores: | Silva, Alejandro1 Artiles, Adriana2 Suárez, William3 Silva, Gilberto3 |
| Instituciones: | 1Ministerio de Ciencia, Tecnología y Medio Ambiente, Empresa de Gestión del Conocimiento y la Tecnología, La Habana. Cuba 2Hospital Hermanos Ameijeiras, Laboratorio de Genética Molecular, La Habana. Cuba 3Museo Nacional de Historia Natural de Cuba, Departamento de Paleogeografía y Paleobiología, La Habana. Cuba |
| Año: | 2011 |
| Volumen: | 28 |
| Número: | 3 |
| Paginación: | 130-135 |
| País: | Cuba |
| Idioma: | Español |
| Tipo de documento: | Nota breve o noticia |
| Enfoque: | Experimental |
| Resumen en español | Con el objetivo de explorar los patrones de variación y la presencia de los dominios y subsecuencias se secuenció la región control mitocondrial (D-loop) completa de Capromys pilorides, un roedor autóctono cubano, y se comparó con la descripción de otros dos roedores hystricognathos caviomorfos. Los resultados mostraron que la región control mitocondrial completa de esta especie cuenta con 1336 pares de bases, y se verificó la presencia de los dominios y las secuencias extendidas asociadas a la terminación (ETAS), central (CD), y bloque de secuencias conservadas (CSB) y las subsecuencias ETAS1, ETAS2, CSB1, CSB2, y CSB3. A su vez, se observó una región de ADN repetitivo entre las subsecuencias CSB1 y CSB2. La región más conservada resultó ser la correspondiente al dominio CD, a la que siguen los dominios ETAS y CSB. El análisis comparativo de la composición de bases entre dominios y de la distancia genética, apoya el propósito de utilizar estas secuencias como fuentes de marcadores útiles para los estudios de genética poblacional, con aplicación a la conservación de esta y otras especies de roedores cubanos afines, algunas de ellas en severo riesgo de extinción |
| Resumen en inglés | The complete mitochondrial DNA (mtDNA) control region from Capromys pilorides, an autochthon Cuban rodent, was sequenced and compared to two other species of hystricognath caviomorph rodents, in order to know patterns of variation and to explore the existence of previously described domains and other elements in rodents. The results revealed that the complete D-loop region of this species is 1336 base pairs long. Our data were compatible with the proposal of three domains [extended terminal associated sequences (ETAS), central (CD), and conserved sequence blocks (CSB)] within the control region, as well as the subsequences ETAS1, ETAS2, CSB1, CSB2, and CSB3. Likewise, a repetitive DNA region between the subsequences CSB1 and CSB2 was observed. The most conserved domain in the mitochondrial control region was the CD domain followed by ETAS and CSB domains in that order. The comparative analysis on base composition and genetic distance support the rationale of using the mitochondrial control region as a source of useful markers for population genetic studies with application to the conservation of this and other related Cuban rodent species, some of them under severe extinction risk |
| Disciplinas: | Biología |
| Palabras clave: | Genética, Mamíferos, ADN mitocondrial, Secuenciación génica, Estudios comparativos, Capromys pilorides, Rodentia |
| Keyword: | Biology, Genetics, Mammals, Mitochondrial DNA, Gene sequencing, Comparative studies, Capromys pilorides, Rodentia |
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