| Journal: | BBR - Biochemistry and biotechnology reports |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000385267 |
| ISSN: | 2316-5200 |
| Authors: | Rocha, Antonio Jose1 Miranda, Rafael de Souza2 Cunha, Rodrigo Maranguape da Silva2 |
| Institutions: | 1Universidade Federal do Ceara, Departamento de Bioquimica e Biologia Molecular, Fortaleza, Ceara. Brasil 2Nucleo de Biotecnologia de Sobral, Laboratorio de Genetica Molecular, Sobral, Ceara. Brasil |
| Year: | 2014 |
| Season: | Jul-Dic |
| Volumen: | 3 |
| Number: | 2 |
| Pages: | 1-8 |
| Country: | Brasil |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental |
| English abstract | This study aimed to compare several DNA polymerases in order to optimize costs of microsatellite amplification reaction through the PowerPlex®16 BIO System. Three different polymerase brands have been used: (i) Paq5000 DNA Polymerase (Stratagene) and (ii) Platinum® Taq DNA Polymerase (Invitrogen), which have low commercial price; and (iii) Advantage 2 Polymerase Mix (Clontech), a DNA polymerase with high commercial price. Herein, neither samples nor positive control amplified in the reactions carried out with Paq5000 DNA Polymerase. Furthermore, the reactions performed with Platinum® Taq DNA Polymerase showed contrasting results, amplifying alleles only in some samples. On the other hand, the two microsatellite loci used (amelogenin e D18S51) were amplified in the analyses carried out with the Advantage 2 Polymerase Mix. Our findings indicated that the enzymes Paq5000 DNA Polymerase and Platinum® Taq DNA Polymerase have low processing capacity, showing inefficiency in the microsatellite detection; and that Advantage 2 Polymerase Mix is highly effective and suitable for microsatellite amplification assays |
| Portuguese abstract | Este estudo objetivou comparar a eficiência de DNA polimerases comerciais em reações de amplificação de microssatélites. Três diferentes marcas de enzimas foram utilizadas: (i) Paq5000 DNA Polymerase (Stratagene) e (ii) Platinum® Taq DNA Polymerase (Invitrogen), que possuem baixo custo comercial; e (iii) Advantage 2 Polymerase Mix (Clontech), uma DNA polimerase com alto preço comercial. Neste estudo, os ensaios conduzidos com a Paq5000 DNA Polymerase não apresentaram amplificação de microssatélites, tanto nas amostras como no controle positivo. Já as reações realizadas com a Platinum® Taq DNA Polymerase mostraram resultados contrastantes, amplificando alelos somente em algumas amostras. Por outro lado, os loci dos dois microssatélites usados (amelogenina e D18S51) foram amplificados nos ensaios com a Advantage 2 Polymerase Mix. Nossos resultados indicam que as enzimas Paq5000 DNA Polymerase and Platinum® Taq DNA Polymerase possuem baixa capacidade de processamento e apresentam ineficiência na detecção de microssatélites; e que Advantage 2 Polymerase Mix é altamente eficiente e apropriada para ensaios de amplificação de microssatélites |
| Disciplines: | Química, Biología |
| Keyword: | Bioquímica, Genética, Amplificación génica, Microsatélites, ADN polimerasa, Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) |
| Keyword: | Chemistry, Biology, Biochemistry, Genetics, Gene amplification, Microsatellites, DNA polymerase, Polymerase chain reaction (PCR) |
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