Identificación biomolecular y patogenicidad de Phytophthora, Pythium y Phytopythium aislados de raíz y suelo en cítricos (Citrus spp.)



Título del documento: Identificación biomolecular y patogenicidad de Phytophthora, Pythium y Phytopythium aislados de raíz y suelo en cítricos (Citrus spp.)
Revista: Anales científicos (Universidad Nacional Agraria La Molina)
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000422921
ISSN: 2519-7398
Autores: 1
2
Instituciones: 1Ministerio de Agricultura y Ganadería, Servicio Fitosanitario del Estado, San José. Costa Rica
2Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Agronomía, Lima. Perú
Año:
Periodo: Jul-Dic
Volumen: 79
Número: 2
Paginación: 393-400
País: Perú
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Resumen en español El objetivo de esta investigación fue identificar las especies de Peronosporales presentes utilizando métodos moleculares. Se recuperaron muestras de las raíces secundarias y suelo de ocho campos correspondientes a las cuatro principales regiones productoras a lo largo de la costa peruana (Piura, Lambayeque, Lima e Ica). Los Peronosporales se aislaron en medios de cultivo PAR, PARH y V8. La identificación molecular se realizó por amplificación de 730 - 820 pb de la región del espaciador transcrito interno (ITS) y de 563 pb de la región del citocromo oxidasa II (Cox II) del ADNr, usando cebadores ITS6/ITS4 y FM66/FM58 respectivamente. Los fragmentos amplificados se secuenciaron utilizando la metodología de Sanger y la reconstrucción filogenética se realizó con análisis bayesiano, utilizando dos millones de generaciones. Los resultados formaron grupos con las secuencias de especies similares depositadas en el GenBank, incluyendo: Phytophthora nicotianae, Phytopythium cucurbitacearum y Pp. vexans (aislados de raíz y de suelo), Ph. parsiana y Pythium splendens (aislados de raíz), Py. aphanidermatum, Py. ultimun, Py. deliense, Pp. amazonianum (aislados de suelo); además, se identificó una especie afín con Pythium guangxiense (aislado del suelo). Por otra parte, se realizaron las pruebas de patogenicidad cumpliendo con los postulados de Koch para cada uno de los aislamientos obtenidos, resultando patogénicos Ph. nicotianae, Ph. parsiana y Pp. vexans
Resumen en inglés The aim of this research was to identify the Peronosporales species using molecular methods. Samples from both secondary roots and soil were recovered from eight fields corresponding to the four main producing regions along the Peruvian coast (Piura, Lambayeque, Lima and Ica). Peronosporales were isolated on PAR, PARH and V8 agar media. Molecular identification was performed by amplification of 730 - 820 bp of the Internal Transcriptional Spacer (ITS) and 563 pb of Cytochrome Oxidase II (CoxII) regions of the rDNA, using ITS6/ITS4 and FM66/FM58 primers respectively. The amplified fragments were sequenced using Sanger methodology and phylogenetic reconstruction was done with Bayesian analysis, using two million generations. The results formed clusters with the similar species sequences deposited in the GenBank, including: Phytophthora nicotianae, Phytopythium cucurbitacearum y Pp. vexans (root and soil isolated), Ph. parsiana y Pythium splendens (root isolated), Py. aphanidermatum, Py. ultimun, Py. deliense, Pp. amazonianum (soil isolated). Also, a species related to Pythium guangxiense (soil isolate) was also identified. On the other hand, pathogenicity tests were carried out complying with Koch’s postulates for each of the isolations obtained, resulting pathogenic Ph. nicotianae, Ph. parsiana and Pp. vexans
Disciplinas: Agrociencias,
Biología
Palabras clave: Hongos,
Fitopatología,
Cítricos,
Peronosporales,
Biología molecular,
Análisis filogenético,
Análisis bayesiano
Keyword: Fungi,
Phytopathogens,
Citrus,
Peronosporales,
Molecular biology,
Phylogenetic analysis,
Bayesian analysis
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