| Revue: | Visión electrónica |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000358821 |
| ISSN: | 1909-9746 |
| Autores: | Becerra, Edilma E1 Camargo, Luz H1 |
| Instituciones: | 1Universidad Distrital "Francisco José de Caldas", Facultad de Ingeniería, Bogotá. Colombia |
| Año: | 2012 |
| Periodo: | Jul-Dic |
| Volumen: | 6 |
| Número: | 2 |
| Paginación: | 58-81 |
| País: | Colombia |
| Idioma: | Español |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Aplicado, descriptivo |
| Resumen en español | La colonización del Helicobacter Pylori en la mucosa gástrica es considerada como un adenocarcinoma debido a que su colonización e infección dentro de la mucosa gástrica influye de manera notable en el desarrollo del cáncer gástrico. Con el análisis del comportamiento eléctrico de las proteínas se pueden predecir interacciones electrostáticas que produzcan el posible encapsulamiento de la bacteria. En este trabajo se realizó un análisis computacional de cuatro proteínas de cada una de las cepas J99 y 26695, que inciden en la adhesión de la bacteria al epitelio gástrico y en el metabolismo, con ayuda de programas de libre acceso en Internet como Compute pI / Mw, Netphos 2.0, Net-Oglyc 3.1 y Net-Nglyc 1.0; para analizar los perfiles de hidrofobicidad se utilizó Protein Hidrophobicity Plot, como herramientas de comparación se utilizó Dot Plot y Dolet. El estudio revela entre 1 y 6 sitios potenciales de N-glicosilación en las proteínas estudiadas, en contraste con la ausencia de sitios potenciales de O-glicosilación e. Las características que debe cumplir la proteína de la familia escogida que encapsule a la bacteria son: punto isoeléctrico ser mayor a 7, con comportamiento eléctricamente positivo dentro del medio básico e hidrofílica. Se propone a las glucoproteínas N-glicosilisadas con radicales de N-acetilglucosamina como posible familia de proteínas encapsuladoras del Helicobacter Pylori |
| Resumen en inglés | The colonization of Helicobacter Pylori in gastric mucosa is considered an adenocarcinoma due to colonization and infection in the gastric mucosa significantly influence the development of gastric cancer. By analyzing the electrical behavior of proteins can be predicted electrostatic interactions that result from the possible encapsulation of the bacteria. In this work, a computational analysis of four proteins in each of the strains J99 and 26695, affecting the adhesion of bacteria to the gastric epithelium and metabolism, using freely available programs on the Internet and Compute pI / Mw, Netphen 2.0, 3.1 and Net-Net-Oglyc Nglyc 1.0, to analyze the hydrophobicity profiles Protein Hidrophobicity Plot was used as comparison tools used Dot Plot and Dolet. The study found between 1 and 6 potential sites for N-glycosylation in the proteins studied, in contrast to the lack of potential sites of O-glycosylation e. The features that should meet the chosen family protein that encapsulates the bacteria are isoelectric point be greater than 7, electrically positive behavior in the basic medium and hydrophilic. It is proposed that N-glycoproteins with radical glicosilisadas N-acetylglucosamine as a possible family of capping proteins of Helicobacter pylori |
| Disciplinas: | Ciencias de la computación, Medicina, Biología |
| Palabras clave: | Bacterias, Bioinformática, Proteínas, Encapsulación, Helicobacter pylori |
| Keyword: | Computer science, Medicine, Biology, Bacteria, Bioinformatics, Proteins, Capping, Helicobacter pylori |
| Texte intégral: | Texto completo (Ver HTML) |
