Detección de rotavirus bovino del grupo A. Análisis filogenético del gen que codifica para la proteina VP7 de su cápside externa



Título del documento: Detección de rotavirus bovino del grupo A. Análisis filogenético del gen que codifica para la proteina VP7 de su cápside externa
Revue: Universitas scientiarum
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000269088
ISSN: 0122-7483
Autores: 1
2
Instituciones: 1Pontificia Universidad Javeriana, Facultad de Ciencias, Bogotá. Colombia
2National Center for Infectious Diseases, Respiratory & Enteric Viruses Branch, Atlanta, Georgia. Estados Unidos de América
Año:
Periodo: Jul
Volumen: 12
Paginación: 37-45
País: Colombia
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, aplicado
Resumen en español Con el objeto de investigar el porcentaje de positividad del rotavirus del grupo A (RV) en un grupo de muestras obtenidas a partir de ganado bovino y examinar la relación evolutiva del gen que codifica para la proteína VP7 entre una cepa bovina aislada en la Sabana de Bogotá y cepas de RV humanas y animales, se recolectaron 74 muestras de materia fecal diarreicas de terneros recién nacidos hasta de un mes de vida en varias fincas de la región. La prueba utilizada para el diagnóstico viral fue la prueba de ELISA encontrándose un porcentaje de positividad del 7%. Del total de las muestras positivas se seleccionó una, la cepa UJ, la cual fue amplificada por RT-PCR, secuenciada y alienada con el programa CLUSTAL W, junto con 13 secuencias más de RV de distintas especies animales y distintos serotipos de RV humanos: 2 de ganado bovino, 3 de ganado porcino, 6 de cepas de RV humano y una de RV de ave, perro y conejo. El análisis filogenético se realizó utilizando el programa MEGA 3.01. Los árboles filogenéticos se elaboraron con el método Neighbour joining y se encontró que la cepa UJ se agrupa cercanamente con una cepa bovina procedente de Eslovenia (SI-B8) mostrando una similitud de 84% y con una cepa inglesa bovina (PP-1), con una similitud del 70% a nivel de su secuencia de aminoácidos. Porcentajes de similitud en aminoácidos entre 48-73% fueron observados con RV de otros humanos y otros animales incluyendo porcinos, la cepa canina, la cepa de conejo y una cepa de virus de aves que sirvió además para enraizar el árbol. Hasta donde llega nuestro conocimiento, este es el primer reporte donde se determina y se caracteriza una cepa de RV bovino en Colombia. Este tipo de hallazgos complementan el conocimiento en cuanto a la gastroenteritis vacuna y permite aportar datos con los que más adelante se pueden generar estrategias para la prevención y el control de esta infección
Resumen en inglés Rotaviruses of group A are the major cause of diarrhea in young calves. To investigate the percentage of group A rotaviruses in newborn calves and examine their evolutionary relationship with those from other animals and humans, we collected 74 fecal specimens from calves of 0-1 month of age with acute diarrhea in towns of Colombia. Using an enzyme-linked immunosorbent assay was found that 7% of specimens were positive for rotaviruses of group A. A representative strain (UJ) was chosen to determine its nucleotide and to deduce amino acid sequences of VP7 gene. Nucleotide sequence of UJ VP7 gene was aligned with corresponding sequences from 15 other strains, including 2 from cattle, 4 from swine, 6 from humans, and 1 each from chickens, dogs, and rabbits, by using Clustal W. Phylogenetic analysis was performed with the MEGA analytical package. UJ strain clusters with a group A rotavirus strain (SI-B8) recently isolated from a calf in Slovenia in the neighbor-joining tree. UJ VP7 gene shares 84% and 70% amino acid sequence identity with the corresponding gene of the recently isolated bovine strains SI-B8 in Slovenia and PP-1 in the United Kingdom. Identities in amino acid sequence between 48-73% were found with rotavirus of group A strains from humans and other animals, including swine, dogs, and rabbits. To our knowledge, this is the first study to detect and characterize a bovine group A rotavirus in Colombia. Findings may increase our understanding of burden of viral gastroenteritis in calves and allow us to develop strategies to prevent and control this important livestock disease
Disciplinas: Medicina,
Biología,
Medicina veterinaria y zootecnia
Palabras clave: Microbiología,
Virus,
Bovinos,
Rotavirus bovino,
Análisis filogenético,
Genes,
Cápside
Keyword: Medicine,
Biology,
Veterinary medicine and animal husbandry,
Microbiology,
Virus,
Bovines,
Bovine rotavirus,
Phylogenetic analysis,
Genes,
Capsid
Texte intégral: Texto completo (Ver PDF)