| Revista: | Revista Mvz Cordoba |
| Base de datos: | |
| Número de sistema: | 000592879 |
| ISSN: | 1909-0544 |
| Autores: | Berdugo-Gutiérrez, Jesus Alfredo1 Tarazona-Morales, Ariel2 Muskus-López, Carlos Echeverry-Zuluaga, Julían1 López-Herrera, Albeiro |
| Instituciones: | 1Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias Agrarias, Medellín, Antioquia. Colombia 2Universidad de Antioquia, Unidad Biología Molecular y computacional PECET, Medellín, Antioquia. Colombia |
| Año: | 2022 |
| Volumen: | 27 |
| Número: | 1 |
| Paginación: | 2013-2013 |
| País: | Colombia |
| Idioma: | Español |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Resumen en inglés | Objetive. This work compares granulosa cell gene expression using RNA analysis from pre-ovulatory follicles from two different bovine species (buffaloes and cattle). Materials and methods. The RNA was obtained from granulosa cells from ovaries of 10 buffaloes and cattle obtained at the local slaughterhouse, was sequenced with Novaseq, and the differential expression was analyzed using EdgeR in Bioconductor, and the function was assigned according to gene ontology terms. Results. Differential gene expression analyzes shown significant differences between species, but the most important feature is the low participation of genes associated with the reproductive process of follicular development, highlighting the importance of paracrine control of the ovary. It was found that between buffaloes and cattle, there is practically no correspondence in the gene expression of the physiological states evaluated; 6137 genes show differential expression between the two species. Conclusions. Each species has its way of performing the same process. The differences in the expression of the genes associated with oxidative phosphorylation are evident, and new ways to look at the presented results are required to understand the biological significance of the findings. |
| Resumen en español | Objetivo. Comparar la expresión génica en células de granulosa de folículos en crecimiento en dos diferentes especies de bovinos (búfalos y vacas). Materiales y métodos. El RNA obtenido de las células de granulosa de 10 vacas y búfalas vacías fue secuenciado con Novaseq y se analizó la expresión génica diferencial usando EdgeR en Bioconductor y su función de acuerdo con los términos de ontología génica Resultados. El análisis de expresión diferencial mostró grandes diferencias entre las especies, fundamentalmente, la poca participación de los genes asociados a los fenómenos reproductivos del desarrollo folicular, poniendo de manifiesto la importancia del control paracrino del ovario. Se encontró que, entre búfalos y vacunos, no hay correspondencia en la expresión génica de los estados fisiológicos evaluados y aunque se pudieron identificar 6137 genes que tienen expresión diferencial entre las dos especies, no se encontró significancia en genes asociados directamente sobre el desarrollo folicular. Conclusiones. Cada especie tiene su forma de realizar el mismo proceso, aunque son evidentes las diferencias en la expresión de genes asociados a la fosforilación oxidativa. Se requieren nuevas formas de analizar los resultados para poder entender el significado biológico de los hallazgos. |
| Disciplinas: | Medicina veterinaria y zootecnia, Medicina veterinaria y zootecnia |
| Palabras clave: | Bufalos, granulosa, folículo, transcriptómica, RNAseq, Bovinos, Reproducción y genética animal |
| Keyword: | Buffaloes, granullosa, follicle, transcriptomics, RNA-Seq, Bovine, Animal reproduction and genetics |
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