Frecuencia de SNP en genes candidatos para crecimiento y su efecto en caracteres de peso vivo en ganado para carne de Tamaulipas



Título del documento: Frecuencia de SNP en genes candidatos para crecimiento y su efecto en caracteres de peso vivo en ganado para carne de Tamaulipas
Revue: Revista mexicana de ciencias pecuarias
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000440090
ISSN: 2007-1124
Autores: 1
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2
1
Instituciones: 1Instituto Politécnico Nacional, Centro de Biotecnología Genómica, Reynosa, Tamaulipas. México
2Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias, Campo Experimental Las Huastecas, Altamira, Tamaulipas. México
Año:
Periodo: Ene-Mar
Volumen: 11
Número: 1
Paginación: 283-293
País: México
Idioma: Español, inglés
Tipo de documento: Nota breve o noticia
Enfoque: Experimental, analítico
Resumen en español El objetivo del estudio fue analizar las frecuencias alélicas de 28 Polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) localizados en genes candidatos para crecimiento en bovinos, así como determinar su efecto sobre rasgos de peso vivo en hatos de las razas Charolais y Simmental. Se tomaron muestras de pelo de 313 animales provenientes de cinco hatos ubicados en cuatro municipios de Tamaulipas y se genotipificaron con la tecnología de Sequenom Mass Array. Todos los marcadores resultaron ser polimórficos en las poblaciones evaluadas y sus frecuencias alélicas fueron significativamente diferentes entre razas (P<0.05). El análisis de asociación determinó que en los animales de la raza Charolais, el marcador PRL+2723 tiene un efecto significativo (P=0.0350) sobre el peso al nacimiento y el marcador localizado en el gen GHR (GHR-6.1), sobre peso al destete (P=0.0226). El GHR-6.1 también se asoció con el peso al año en los animales de la raza Simmental. El marcador LEP-3100 (P=0.0249) también tuvo un efecto significativo sobre el peso al destete en los animales Simmental. El panel probado es polimórfico en las dos razas evaluadas y tres de los marcadores tuvieron efecto significativo en los parámetros de peso vivo evaluados, por lo que tienen el potencial de validarse y usarse como una herramienta adicional en la selección y mejoramiento genético del ganado de carne en Tamaulipas
Resumen en inglés A full understanding of how specific genes affect live weight variables is required for their incorporation into genetic improvement programs. An analysis was done of the allelic frequencies of 28 single nucleotide polymorphisms (SNP) located in candidate genes for growth in cattle to identify their effect on live weight traits in Charolais and Simmental herds in the state of Tamaulipas, Mexico. Hair samples were collected from 313 animals and genotyped using the Sequenom MassARRAY system. Genotype analysis showed that all the markers were polymorphic in the evaluated populations and their allelic frequencies were significantly different between the two breeds (P<0.05). An association analysis found that in the Charolais population the marker PRL + 2723 had a significant effect (P= 0.0350) on birth weight and the marker GHR-6.1 affected weaning weight (P= 0.0226). In the Simmental population GHR-6.1 was associated with yearling weight and the marker LEP-3100 (P=0.0249) had a significant effect on weaning weight. The tested 28 SNP panel is polymorphic in both breeds and three of the markers had a significant effect on the evaluated live weight parameters. They can therefore be potentially validated for use as tools in the selection and breeding of beef cattle in Tamaulipas
Disciplinas: Agrociencias
Palabras clave: Reproducción y genética animal,
Bovinos,
México,
Tamaulipas,
Ganado de engorda,
Somatotipos,
SNP,
Frecuencia alélica,
Peso
Keyword: Bovines,
Mexico,
Tamaulipas,
Beef cattle,
Somatotypes,
SNP,
Allelic frequence,
Weight
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