Identificación de genes específicos asociados con la elongación del tallo en el arroz (Oryza sativa L.) a través del microarreglo de ADNc
Título del documento: Identificación de genes específicos asociados con la elongación del tallo en el arroz (Oryza sativa L.) a través del microarreglo de ADNc
Revista: Revista de protección vegetal
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000399737
ISSN: 1010-2752
Autores: 1
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2
2
Instituciones: 1Universidad Agraria de La Habana, Facultad de Agronomía, La Habana. Cuba
2Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang. China
Año:
Periodo: May-Ago
Volumen: 24
Número: 2
Paginación: 87-93
País: Cuba
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental
Resumen en español El arroz (Oryza sativa L.) es uno de los cultivos más importantes en el mundo. La giberelina es una hormona que controla diferentes aspectos importantes en el desarrollo de las plantas. De ahí la necesidad de conocer como esta responden a la hormona y las posibles modulaciones de sus concentraciones. El presente trabajo tuvo como objetivo evaluar a través del microarreglo de ADNc la expresión de secuencias etiquetadas expresadas (Expressed sequences tag, ESTs) obtenidas a partir del tejido del tallo de la variedad Hangfeng tratada con aplicaciones de la fitohormona giberelina durante 36 horas. Para profundizar en el conocimiento sobre el genoma de este cultivo se realizó un análisis de la expresión de 2 535 secuencias etiquetadas expresadas mediante la construcción de un microarreglo de Ácido desoxirribonucleico complementario (ADNc). Las plantas se trataron con giberelina por 36 horas y las muestras de los tejidos del tallo se tomaron cuando se observaron en las plantas de cinco a seis hojas para proceder a la extracción del Ácido ribonucleico (ARN) total según el método del Trizol. Un total de 1129 ESTs se clasificaron en 18 categorías funcionales de acuerdo a lo establecido por el Centro de Información de Munich para Secuencias de Proteínas (Munich Information Center for Protein Sequences, MIPS). La mayoría de los transcriptos tentativos únicos estuvieron relacionados con las categorías de metabolismo (18.5%) y energía (16.19%) para un total de 214 y 181 ESTs respectivamente. Como resultado del microarreglo se obtuvieron 10 ESTs en el tratamiento durante 36 horas con la fitohormona, de las cuales cuatro secuencias: (Tubulina cadena beta-1, Auxinaa-IAA16, Actina factor de despolimerización 5 y Xiloglucan endotransglucosilasa) no se habían informado con anterioridad en Orysa sativa. Los resultados del microarreglo se confirmaron mediante la PCR en tiempo real
Resumen en inglés Rice (Oryza sativa L.) is one of the most important crops in the world. For this reason it is necessary to know how plants respond to it and the possible modulation of their concentrations. The aim of this research was to evaluate through cDNA microarray the expression of expressed sequence tags obtained from the stem tissue in a variety of rice "Hangfeng" treated with applications of the phytohormone gibberellin for 36 hours. Gibibberellin is a hormone that controls several important aspects in the development of plants. Thus, to go deepen in knowledge about this crop genome, an analysis of 2535 expressed sequence tags (ESTs) was done using microarray technology. Plants were previously treated with gibberelen phytohormone at 36 hours and stem tissue samples were taken when plants had from five to six leaves to proceed with total ARN extraction (Trizol method). A total of 1129 ESTs was classified into 18 functional categories according to the requirements established by the Munich Information Center for Protein Sequences (MIPS). Unique transcripts were involved in metabolism (18.5%) and energy (16. 19%) for a total of 214 and 181 ESTs respectively. As microarray result, 10 ESTs were generated at the 36 hour-treatment with the phytohormone, and four of those ESTs (Tubulin beta-1 chain, Auxin-responsive protein IAA16, Actin-depolymerizing factor 5 and Xyloglucan endotransglucosylase) had never been reported before in Oryza sativa L. Array results were confirmed using real time PCR
Disciplinas: Agrociencias,
Biología
Palabras clave: Gramíneas,
Genética,
Arroz,
Oryza sativa,
ADNc,
Giberelinas,
Cuba,
Elongación,
Tallo
Keyword: Agricultural sciences,
Biology,
Gramineae,
Genetics,
Rice,
Oryza sativa,
cDNA,
Gibberellins,
Stem,
Elongation,
Cuba
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