| Revue: | Revista ciencia agronomica |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000422564 |
| Autores: | Wamser, Gerson Henrique1 Coimbra, Jefferson Luís Meirelles2 Guidolin, Altamir Frederico2 Lannes, Sergio Dias1 Dalagnol, Gilberto Luiz3 |
| Instituciones: | 1Empresa de Pesquisa Agropecuaria e Extensao Rural de Santa Catarina-Epagri, Estacao Experimental de Ituporanga, Ituporanga, Santa Catarina. Brasil 2Universidade do Estado de Santa Catarina, Instituto de Melhoramento e Genética Molecular, Lages, Santa Catarina. Brasil 3Empresa de Pesquisa Agropecuaria e Extensao Rural de Santa Catarina, Estacao Experimental de Lages, Lages, Santa Catarina. Brasil |
| Año: | 2014 |
| Periodo: | Jul-Sep |
| Volumen: | 45 |
| Número: | 3 |
| Paginación: | 573-580 |
| País: | Brasil |
| Idioma: | Portugués |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental, analítico |
| Resumen en inglés | The genetic divergence has been measure between fifteen genotypes of onion grown in Santa Catarina using RAPD markers. Eleven primers from Operon Technologies series was used to produced 35 markers, these, 28 were polymorphic. The amplification products were visualized on 1.4% agarose gel stained with ethidium bromide. A similarity matrix using the Jaccard coefficient was constructed with the molecular data. A dendrogram was generated to better visualize the genetic similarity using a clustering method UPGMA. Three groups were formed using the similarity coefficient 0.6 as cutoff point. The first group met genotypes Super Superprecoce and Gauchinha. The second group met twelve genotypes. Into this group, the genotypes Bella Vista and Bella Dura were those with the greatest similarity coefficient, around 0.89. Bela Vista and Superprecoce, Catarina and the hybrid Bella Vista, with similarity coefficient of 0.88 between the pairs. The third group had only the genotype Crioula Roxa, which had the lowest value (0.31) for the similarity coefficient. Given these results, crosses between the genotypes of the first and second group and those with genotype Crioula Roxa can be better, because they have greater divergence between them. The RAPD technique proved effective in the molecular characterization of genotypes of onion, showing that there is variability among the genotypes |
| Resumen en portugués | A divergência genética foi avaliada entre quinze genótipos de cebola cultivados em Santa Catarina, com a utilização de marcadores moleculares RAPD. Onze oligonucleotídeos iniciadores da série Operon Technologies foram utilizados e produziram 35 marcadores, destes, 28 foram polimórficos. Os produtos da amplificação foram visualizados em gel de agarose 1,4%, corado com brometo de etídeo. Uma matriz de similaridade utilizando-se o coeficiente de Jaccard foi construída a partir dos dados moleculares. Um dendrograma foi gerado para melhor visualização da similaridade genética através do método de agrupamento UPGMA. Três grupos foram formados utilizando o coeficiente de similaridade 0,6 como ponto de corte. O primeiro grupo reuniu os genótipos Super Superprecoce e Gauchinha. O segundo grupo reuniu doze genótipos. Dentro desse grupo, os genótipos Bella Vista e Bella Dura foram os que apresentaram o maior coeficiente de similaridade, em torno de 0,89. Bela Vista e Superprecoce, Catarina e o híbrido Bella Vista, com coeficiente de similaridade de 0,88 entre os pares. O terceiro grupo apresentou apenas o genótipo Crioula Roxa, que obteve o menor valor (0,31) para o coeficiente de similaridade. Tendo em vista os resultados obtidos, cruzamentos entre os genótipos do primeiro e segundo grupo e destes com o genótipo Crioula Roxa, podem ser melhores por apresentarem maior divergência entre si. A técnica de RAPD mostrou-se eficaz na caracterização molecular dos genótipos de cebola, evidenciando que existe variabilidade entre os genótipos estudados |
| Disciplinas: | Biología |
| Palabras clave: | Genética, Hortalizas, Divergencia genética, Cebolla, Allium cepa, Marcadores moleculares |
| Keyword: | Vegetables, Genetics, Genetic divergence, Onion, Allium cepa, Molecular markers |
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