Tecnicas de analise do perfil de execucao e otimizacao de programas em quimica computacional



Título del documento: Tecnicas de analise do perfil de execucao e otimizacao de programas em quimica computacional
Revue: Quimica nova
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000199848
ISSN: 0100-4042
Autores: 1

Instituciones: 1Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica, Campinas, Sao Paulo. Brasil
Año:
Periodo: May-Jun
Volumen: 25
Número: 3
Paginación: 465-469
País: Brasil
Idioma: Portugués
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Teórico, divulgación
Resumen en inglés In this paper we review the basic techniques of performance analysis within the UNIX environment that are relevant in computational chemistry, with particular emphasis on the execution profile using the gprof tool. Two case studies (in ab initio and molecular dynamics calculations) are presented in order to illustrate how execution profiling can be used to effectively identify bottlenecks and to guide source code optimization. Using these profiling and optimization techniques it was possible to obtain significant speedups (of up to 30%) in both cases
Disciplinas: Química,
Ciencias de la computación,
Física y astronomía
Palabras clave: Fisicoquímica y química teórica,
Física atómica y molecular,
Química computacional,
Cálculos ab initio,
Moléculas,
Dinámica molecular
Keyword: Chemistry,
Computer science,
Physics and astronomy,
Physical and theoretical chemistry,
Atomic and molecular physics,
Computational chemistry,
Ab-initio,
Molecules,
Molecular dynamics
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