Saturación de un mapa genético de trigo candeal y detección de QTL asociados a actividad de lipoxigenasas



Título del documento: Saturación de un mapa genético de trigo candeal y detección de QTL asociados a actividad de lipoxigenasas
Revue: Phyton
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000323490
ISSN: 0031-9457
Autores: 1
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Instituciones: 1Universidad Nacional del Sur, Departamento de Agronomía, Bahía Blanca, Buenos Aires. Argentina
Año:
Volumen: 77
Paginación: 175-188
País: Argentina
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, aplicado
Resumen en español Los objetivos de este trabajo fueron la saturación de un mapa genético de trigo candeal y el posterior mapeo de QTL, a fin de identificar regiones genómicas relacionadas con la actividad de lipoxigenasas. También se estimó la utilidad de los marcadores ligados a estas regiones como herramientas de selección de genotipos para mejorar el color de la pasta. Para tal fin se utilizó una población de mapeo obtenida por el método de descendencia de una sola semilla constituida por 83 líneas recombinantes endocriadas (RILs) derivadas del cruzamiento entre los trigos candeales Kofa y UC1113 (Triticum turgidum L. var. durum). Se mapearon 44 AFLPs, 9 RAPDs, 2 isoenzimas y 1 proteína de reserva sobre un mapa base de 269 marcadores. La longitud total del mapa resultante fue de 1847,4 cM, con una distancia promedio entre pares de marcadores de 5,68 cM. El mapeo por el método de intervalos compuestos (CIM) indicó la presencia de un QTL mayor, en el cromosoma 4B, que explica un 58% de la variación fenotípica de la actividad de lipoxigenasas. La posición más probable del QTL (LOD=19,00) fue obtenida entre los marcadores “ksm62” y “wmc617b”. Estos resultados fueron consistentes en dos años y a dos pH diferentes
Resumen en inglés The aims of this work were (1) the saturation of a linkage map of durum wheat using AFPLs and RAPDs, (2) mapping of QTL related to lipoxygenase activity and (3) estimation of its usefulness in marker-assisted selection to increase pasta colour. A mapping population of 83 recombinant lines (RILs) derived from the cross between durum wheat Kofa and UC1113 (Triticum turgidum L. var. durum) was evaluated for lipoxygenase activity during two growing seasons. It was used to generate a genetic map. Forty four AFLPs, 9 RAPDs, 2 isoenzymes and 1 storage protein were mapped onto a previous genetic map consisting on 269 markers. The total length of the map obtained was 1847.4 cM, with an average genetic distance between pairs of markers of 5.68 cM. The composite interval mapping (CIM) showed the presence of a major QTL explaining 58% of phenotypic variation in lipoxygenase activity on chromosome 4B. The highest LOD value (LOD=19,00) was obtained between the “ksm62” and “wmc617b” markers. These results were consistent in the two sampling years and at the two pH in which lipoxygenase activity was analyzed
Disciplinas: Agrociencias,
Química
Palabras clave: Gramíneas,
Bioquímica,
Genética,
Mapeo genético,
Marcadores moleculares,
Actividad enzimática,
Lipoxigenasas,
Triticum turgidum
Keyword: Agricultural sciences,
Chemistry,
Gramineae,
Biochemistry,
Genetic mapping,
Molecular markers,
Enzymatic activity,
Lipoxygenases,
Triticum turgidum,
Genetics
Texte intégral: Texto completo (Ver PDF)