Detección de los genes phlD y hcnC en bacterias antagonistas productoras de sideróforos asociadas a Rubus fruticosus L



Título del documento: Detección de los genes phlD y hcnC en bacterias antagonistas productoras de sideróforos asociadas a Rubus fruticosus L
Revue: Nova scientia
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000439640
ISSN: 2007-0705
Autores: 1
1
1
1
1
2
3
Instituciones: 1Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, Instituto de Investigaciones Químico Biológicas, Morelia, Michoacán. México
2Universidad de la Ciénega del Estado de Michoacán de Ocampo, Genómica Alimentaria, Sahuayo, Michoacán. México
3Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, Facultad de Agrobiología "Presidente Juárez", Uruapan, Michoacán. México
Año:
Periodo: May
Volumen: 12
Número: 24
País: México
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Aplicado, descriptivo
Resumen en español Introducción: Las plantas albergan un microbioma que incluye bacterias promotoras del crecimiento vegetal, las cuales pueden fungir como agentes biológicos que antagonizan el crecimiento de fitopatógenos, disminuyendo o eliminando su efectos nocivos en plantas. En este trabajo se evaluó la presencia de los genes antifúngicos phlD y hcnC con la producción de sideróforos (agentes quelantes de Fe) en bacterias aisladas de la endósfera y rizósfera de plantas de zarzamora (Rubus fruticosus L.). Método: Se analizaron 410 aislados bacterianos asociados a plantas de zarzamora (Rubus fruticosus L.), provenientes de la rizósfera (205) y endosfera (205) para la detección de los genes antimicrobianos phlD y hcnC por reacción en cadena de la polimerasa y posterior secuenciación. La búsqueda de los genes se realizó únicamente en cepas productoras de sideróforos, utilizando el medio CAS (Cromo Azurol) para su producción. De las cepas seleccionadas, se realizaron los bioensayos de antagonismo contra los patógenos de plantas Botrytis cinerea, Fusarium oxysporum, F. solani y Rhizoctonia solani. Resultados: Los resultados de este trabajo muestran que, de los 410 aislados bacterianos analizados (50% rizosféricos y 50% endófitos), 70 aislados fueron productores de sideróforos (24 rizosféricas y 46 endófitas). Se observó que el 70% (49/70) de las cepas productoras de sideróforos, presentaron uno o dos de los genes phlD y/o hcnC. Las secuencias nucleotídicas de los genes phlD y/o hcnC mostraron una alta identidad con genes homólogos a las especies Pseudomonas sp., P. fluorescens, P. chlororaphis, P. protegens, P. putida y P. brassicacearum. La abundancia del gen hcnC fue mayor en los aislados endófitos y rizosféricos (36/70), con respecto al gen phlD (13/70). Se detectaron mayoritariamente los genes phlD y/o hcnC en cepas aisladas de la endósfera (43/70), comparado con aquellas cepas rizosféricas (6/70). Finalmente, se observó una alta rel
Resumen en inglés Introduction: The plants harbor a microbiome that includes plant growth-promoting bacteria, which can act as biological agents that antagonize the growth of phytopathogens, diminishing or eliminating their harmful effects in plants. In this work, the presence and association of the phlD and hcnC antifungal genes with the production of siderophores (Fe chelating agents) in bacteria isolated from the endosphere and rhizosphere of blackberry plants (Rubus fruticosus L.) was evaluated. Method: In total, 410 bacterial isolates associated with blackberry plants (Rubus fruticosus L.), from the rhizosphere (205) and endosphere (205) were analyzed for the detection of the phlD and hcnC antimicrobial genes by polymerase chain reaction and subsequent sequencing. The search of the genes was carried out only in siderophore producing strains, using the CAS medium (Chromium Azurol) for its production. Of the strains selected, antagonism bioassays were carried out against the plant pathogens Botrytis cinerea, Fusarium oxysporum, F. solani and Rhizoctonia solani. Results: The results showed that from the 410 bacterial isolates analyzed here (50% endophytes and 50% rhizospheric), it was confirmed that 70 strains were siderophores-producing (24 from rhizosphere and 46 endophytes). It was observed that 70% (49/70) of the siderophore producing strains present either one or two of the phlD or hcnC genes. The nucleotide sequences of the phlD and hcnC genes showed high identity to homologous genes to species Pseudomonas sp., P. fluorescens, P. chlororaphis, P. protegens, P. putida and P. brassicacearum. The abundance of the hcnC gene was also higher in the endophytic and rhizospheric isolates (36/70), with respect to the phlD gene (13/70). Greater detection of phlD or hcnC genes was found in strains isolated from the endosphere (43/70), compared with those of rhizospheric origin (6/70). Finally, a high ratio was observed between the production of siderophores, the presence
Disciplinas: Agrociencias
Palabras clave: Fitopatología,
Hongos,
Zarzamora,
Hongos fitopatógenos,
Bacterias antagonistas,
Control biológico,
2,4-diacetilfloroglucinol,
Acido cianhídrico,
Pseudomonas,
Rubus fruticosus,
Rosaceae
Keyword: Phytopathology,
Fungi,
Blackberry,
Phytopathogenic fungi,
Antagonist bacteria,
Biological control,
2,4-diacetylphloroglucinol,
Cyanhydric acid,
Pseudomonas,
Rubus fruticosus,
Rosaceae
Texte intégral: Texto completo (Ver HTML) Texto completo (Ver PDF)