Selección fenotípica de progenies endocriadas de germoplasma irradiado de yuca (Manihot esculenta Crantz) para análisis Tilling



Título del documento: Selección fenotípica de progenies endocriadas de germoplasma irradiado de yuca (Manihot esculenta Crantz) para análisis Tilling
Revista: Multiciencias
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000332071
ISSN: 1317-2255
Autores: 1
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Instituciones: 1Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria, Estación Experimental Motilonia, Motilonia. Colombia
2Universidad Popular del César, Facultad de Ingeniería, Valledupar, César. Colombia
3Centro Internacional de Agricultura Tropical, Programa de Mejoramiento de Yuca, Palmira, Valle del Cauca. Colombia
4University of Washington, Department of Biology, Seattle, Washington. Estados Unidos de América
Año:
Volumen: 9
Número: 3
Paginación: 233-241
País: Venezuela
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental, aplicado
Resumen en español La tendencia creciente en yuca, es su utilización agroindustrial, lo que explica en gran medida el salto en la investigación del cultivo, hacia el aprovechamiento de su potencial biotecnológico. El TILLING, es una aproximación no transgénica de genética reversa que se acopla a la mutagénesis para detectar polimorfismos en genes de interés.Actualmente, el método utilizado para detectar los productos de corte es la electroforesis en acrilamida, acoplada a una plataforma de genotipado de alto rendimiento. Se ha buscado simplificar la detección convencional de los productos de corte deCELI en geles de agarosa para hacer la técnica más accesible a investigadores, con acceso limitado a equipos. Semillas botánicas de cinco familias de yuca se irradiaron con rayos gamma y neutrones rápidos. Las plantas derivadas (M1), se autopolinizaron para producir una generación M2, conformada por 1.500 líneas. Se seleccionó un subgrupo de 150 líneas mutantes probables, identificadas mediante evaluación fenotípica para incrementar la probabilidad de detección de polimorfismos en una muestra pequeña para el análisis por TILLING convencional y, con la modificación metodológica a validar, utilizando nueve genes objetivo. El cuello de botella de la técnica TILLING se acentúa debido al desconocimiento de la arquitectura genómica completa del cultivo pues se requieren técnicas adicionales de evaluación de calidad de productos de amplificación de cebadores y la aplicación de la metodología convencional para la evaluación de SNPs por TILLING en yuca
Resumen en inglés The growing trend in cassava cultivation is its utilization as an industrial crop that largely explains the jump that has emerged in cassava research takes advantage its biotechnological potential. TILLING is an approximation of non-transgenic genetic reverse that is coupled to mutagenesis to identify polymorphisms in genes of interest. Currently, the common method used to detect cleaved products is by polyacrylamide gel electrophoresis using a highthroughput genotyping platform. We have sought to simplify the detection of CEL I-cleaved products in conventional agarose gels to make the technique more accessible to researchers where access to instrumentation is limited. Botanical seed from five different cassava families were irradiated with ã rays and fast neutrons. Plants M1, self-pollinated to produce theM2generation comprising 1.500 lines. A subset of 150 mutant lines identified by phenotipical screening to increase the detection probability of polymorphisms in a small sample for analysis by conventional TILLING and methodological changes to validate, using nine target genes. The bottleneck of the TILLING technique is accentuated in cassava due to lack of complete genomic architecture that still persists and requires additional techniques to evaluate quality amplification products of primers and the application of the conventional methodology for the evaluation of SNPs by TILLING in cassava
Disciplinas: Agrociencias,
Biología
Palabras clave: Fitotecnia,
Angiospermas,
Mejoramiento genético,
Mutaciones inducidas,
Radiación,
Polimorfismos de nucleótido único (SNPs),
Yuca,
Manihot esculenta
Keyword: Agricultural sciences,
Biology,
Crop husbandry,
Angiosperms,
Plant breeding,
Induced mutations,
Radiation,
Single nucleotide polymorphism (SNPs),
Cassava,
Manihot esculenta
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