| Revue: | Journal of the Brazilian Chemical Society |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000311147 |
| ISSN: | 0103-5053 |
| Autores: | Fisher, Luke S1 Güner, Osman F |
| Instituciones: | 1Accelrys Inc., San Diego, California. Estados Unidos de América |
| Año: | 2002 |
| Periodo: | Dic |
| Volumen: | 13 |
| Número: | 6 |
| Paginación: | 777-787 |
| País: | Brasil |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Analítico, prospectivo |
| Resumen en inglés | We developed a procedure that identifies "novel" biologically active compounds that are expected to be distinct from known active compounds with respect to specificity and other such characteristics. The procedure involves mapping a set of known active compounds (training set) onto all possible hydrogen bonding and lipophilic interaction sites of an enzyme active site and flagging those interactions that are utilized by the training set. These flagged sites are removed (except for those that are deemed critical binding sites), leaving only potential interaction sites not utilized by the active compounds. Once unflagged sites were enumerated, pharmacophore models were then generated, scored, and prioritized where the top pharmacophore model was used to search 3D databases for identifying new leads. This procedure was applied to HIV-1 protease inhibitors. Several compounds retrieved by the top pharmacophore model were identified as moderately active (in muMolar range) |
| Resumen en portugués | Neste artigo mostramos um procedimento desenvolvido em nossos laboratórios que identifica "novos" compostos biologicamente ativos distintos de compostos previamente conhecidos no que diz respeito à especificidade da ação e outras características. O procedimento envolve o mapeamento de uma série de compostos ativos (série de treinamento), através de interações lipofílicas e de ligações hidrogênio com o sítio de uma enzima ativa. As interações identificadas e mapeadas são, então, removidas (com exceção daqueles sítios de interação criticamente importantes) e, apenas as interações não utilizadas pelos compostos ativos são mantidas. Os modelos farmacofóricos são gerados e escalonados para os sítios previamente enumerados. Esse modelo é então usado para varreduras de bancos de dados tridimensionais e identificação de novas substâncias matrizes. Este procedimento foi aplicado para inibidores da protease do vírus HIV-1. Vários compostos com atividade moderada na ordem de "micro"(letra mi)Molar foram selecionados pelo modelo farmacofórico proposto |
| Disciplinas: | Química |
| Palabras clave: | Química farmacéutica, Diseño de fármacos, Farmacóforos, Diseño basado en estructura, Bases de datos |
| Keyword: | Chemistry, Medicinal chemistry, Drug design, Pharmacophores, Structure-based design, Databases |
| Texte intégral: | Texto completo (Ver HTML) |
