| Revista: | Fitosanidad (La Habana) |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000361887 |
| ISSN: | 1562-3009 |
| Autores: | Soto Sedano, Johana Carolina1 López Carrascal, Camilo Ernesto2 |
| Instituciones: | 1Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Agronomía, Bogotá. Colombia 2Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias, Bogotá. Colombia |
| Año: | 2012 |
| Periodo: | Ago |
| Volumen: | 16 |
| Número: | 2 |
| Paginación: | 101-113 |
| País: | Cuba |
| Idioma: | Español |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Teórico, descriptivo |
| Resumen en español | El conocimiento del transcriptoma y su regulación es fundamental para la interpretación articulada de los diversos constituyentes moleculares que integran la red de respuesta génica ante un determinado evento inductor, como los que se presentan en interacciones planta-patógeno. La actual tecnología de secuenciación ha llevado al desarrollo del RNA-seq como herramienta transcriptómica que permite el secuenciamiento masivo de ADNc o ARN, y hace posible obtener perfiles de expresión génica de las respuestas de defensa, lo cual ofrece grandes posibilidades para profundizar en el entendimiento de los mecanismos que se activan durante las respuestas inmunes en plantas. El RNA-seq ha cambiado la manera de cómo se estudian los transcriptomas, y ha permitido identificar y cuantificar nuevos y conocidos transcriptos relacionados con defensa vegetal. Aquí se presenta el principio, aplicaciones y ventajas del RNA-seq; además se discuten trabajos recientes que revelan la importancia y utilidad de esta herramienta en estudios de interacciones planta patógeno |
| Resumen en inglés | The knowledge gained from transcriptome and its regulation is essential to articulate the constituents that make up the molecular network of response gene induction for a certain event, such as those occurring in plant pathogen interactions. The current sequencing technology has led to the development of RNA-seq as a tool that enables mass sequencing of cDNA or RNA, making possible to obtain gene expression profiles for defense responses, which offers great potential to deepen the understanding of mechanisms that are activated during immune responses in plants. RNA-seq is changing the way of how we used to study the transcriptome and has helped identify and quantify new and known plant defense related transcripts. Here, it has present the basis, applications and advantages of RNA-seq, also are discussed recent studies that have revealed the importance and usefulness of this tool for studies of plant pathogen interactions |
| Disciplinas: | Agrociencias, Biología, Ciencia y tecnología |
| Palabras clave: | Fitopatología, Genética, Tecnología, ADN, ARN, Secuenciación génica, Transcripción génica, Relación huésped-parásito |
| Keyword: | Agricultural sciences, Biology, Science and technology, Phytopathology, Genetics, Technology, DNA, RNA, Gene sequence, Gene transcription, Host-parasite |
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