| Revue: | Estudos de biologia |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000321569 |
| ISSN: | 0102-2067 |
| Autores: | Freitas, Claudia1 Bendhack, Fabiano2 Netto, Sylvio Pellico1 Madeira, Humberto Maciel Franca1 Eyre Gabriel, Jane3 |
| Instituciones: | 1Pontificia Universidade Catolica do Parana, Centro de Ciencias Ambientais e Agrarias, Sao Jose dos Pinhais, Parana. Brasil 2Pontificia Universidade Catolica do Parana, Centro de Propagacao e Producao de Organismos Marinhos, Sao Jose dos Pinhais, Parana. Brasil 3Universidade Estadual da Paraiba, Centro de Ciencias Exatas e Sociais Aplicadas, Patos, Paraiba. Brasil |
| Año: | 2007 |
| Periodo: | Abr-Jun |
| Volumen: | 29 |
| Número: | 67 |
| Paginación: | 151-156 |
| País: | Brasil |
| Idioma: | Portugués |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Experimental, analítico |
| Resumen en inglés | Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) markers are DNA fragments from PCR amplification of random segments of genomic DNA with single primer of arbitrary nucleotide sequence. Although this technique has some limitations, RAPD does not require any specific knowledge of the DNA sequence of the target organism unlike traditional PCR analysis. Within this context, the aim of the present study was to establish experimental procedure for the normalization of arbitrary amplification reactions from tissues isolated by fat snook Centropomus parallelus. Under these experimental conditions, a variable eletrophoretical profile was revealed in RAPD-PCR from genomic DNA samples of fat snook, whose amplified products had great clearness with molecular sizes ranging from 100 to 3,000 bp. RAPD-PCR products generated monomorphic DNA fragments, when the primers AM13, OPW5 and OPA20 were tested. Nevertheless, considerable variations in the size and number of amplified products were detected exclusively in reactions performed in the presence of primer OPX4. The results presented in this study describe the optimization of experimental procedure in order to normalize the steps involved in arbitrary amplification reactions from genomic DNA samples of fat snook. These findings create real possibilities for the use of RAPD-PCR as powerful tool in genetic variability and diversity between populations of fat snook C. parallelus, leading to further development of distinct molecular genetic analysis by using such experimental approach |
| Resumen en portugués | O marcador molecular RAPD vem sendo amplamente empregado em análises moleculares, proporcionando grandes avanços aos estudos de avaliação da estrutura genética entre populações de uma grande variedade de organismos. Entretanto, determinadas limitações diretamente associadas à extração de DNA genômico e às condições de amplificação costumam restringir seu emprego. Nesse contexto, o presente estudo teve como objetivo estabelecer protocolos de otimização de reações de amplificação aleatória de DNA polimórfico a partir de amostras de tecidos isoladas de Centropomus parallelus a fim de assegurar maior reprodutibilidade e alto poder discriminatório dessa técnica. Um perfil eletroforético altamente variável foi detectado nas reações de amplificação aleatória do DNA genômico de robalo peva, sendo observados produtos amplificados com alta nitidez e tamanhos variando entre 100 a 3.000 pb. Os produtos de RAPD-PCR produziram um padrão de bandas altamente monomórfico, quando os primers AM13, OPW5 e OPA20 foram testados. Entretanto, consideráveis variações no tamanho e número de bandas amplificadas foram observadas apenas nas reações realizadas na presença do primer OPX4. As descobertas apresentadas no presente estudo descrevem o estabelecimento de determinados procedimentos experimentais a fim de viabilizar os ensaios de amplificação arbitrária a partir de amostras de DNA genômico de robalo peva C. parallelus por análises de RAPD. Tais descobertas criam reais possibilidades para o uso da técnica de RAPD-PCR como ferramenta auxiliar nas análises de variabilidade e diversidade genética entre populações de robalo peva C. parallelus, possibilitando futuramente o desenvolvimento de diferentes trabalhos genético-moleculares empregando tal procedimento experimental |
| Disciplinas: | Biología |
| Palabras clave: | Genética, Peces, Centropomus parallelus, ADN polimórfico, Robalo, Marcadores moleculares, RAPD, Biología molecular |
| Keyword: | Biology, Fish, Genetics, Centropomus parallelus, DNA polymorphism, Snook, Molecular markers, RAPD, Molecular biology |
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