Diversidad genética molecular de Mirabilis expansa mediante RAPD



Título del documento: Diversidad genética molecular de Mirabilis expansa mediante RAPD
Revue: Ecología aplicada
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000327527
ISSN: 1726-2216
Autores: 1
1
1
1
2
3
Instituciones: 1Universidad Nacional Agraria La Molina, Instituto de Biotecnología, La Molina, Lima. Perú
2Universite de Liege, Faculte Universitaire des Sciences Agronomiques de Gembloux, Gembloux, Namur. Bélgica
3Universidad Nacional de Cajamarca, Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales, Cajamarca. Perú
Año:
Periodo: Dic
Volumen: 5
Número: 1-2
Paginación: 81-86
País: Perú
Idioma: Español
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Analítico, descriptivo
Resumen en español Se estudió la diversidad genética mediante la técnica de RAPD en 37 accesiones de una colección del norte del Perú de “chago” o “mauka” Mirabilis expansa; Se obtuvieron 60 marcadores polimórficos con 9 de 19 iniciadores decaméricos. Se calcularon los índices de iniciador RAPD, obteniéndose los valores más altos con los iniciadores OPA04, OPA09 y OPA13, lo cual sugiere su uso valioso en futuras investigaciones con RAPD en colecciones más grandes o para especies de Mirabilis. Con el coeficiente de Simple Matching y el algoritmo UPGMA se obtuvo un dendograma del cual, a un coeficiente de 1, se observan 31 grupos. Esto indicaría unos 16.216 % de posibles duplicados en la colección de Germoplasma. Con un índice de similitud de 0.85 se encontró que se forman 8 clusters o grupos, sin coincidir en su mayoría con los 5 morfotipos reportados. Además se realizó un Análisis Molecular de Variancia con 2 componentes: interregional y entre accesiones/ región, cuyos valores fueron 21.69% y 78.3%, respectivamente; valores que sugieren una considerable contribución de variación genética gracias a las muestras de diversas partes del país
Resumen en inglés A collection of 37 accessions of Mirabilis expansa, “chago” or “mauka” from northern Perú, was analyzed by RAPD assays and the molecular genetic diversity determined. In order to know which primer was more informative, the PIC values were summed up and a RAPD primer index calculated, resulting in the primers OPA04, OPA09 y OPA13 with the highest indexes, suggesting their potential utility in further research in Mirabilis species. From 9 of the 19 RAPD primers selected, we obtained 60 polymorphic markers, which yielded a Simple Matching Coefficient Dendogram, which shows 31 groups at a similarity index of 1. It also indicates a 16.216% of possible duplicates in the collection and with a similarity index of 0,85 we observed 8 clusters, with a significant difference compared to the morphological characterization data. An Analysis of Molecular Variance was performed, separating 2 variation components: among regions and among accessions/within region. The values obtained were 21,69% and 78,3% respectively, being both relatively high and showing considerable contribution of genetic variation from samples of diverse collection places
Disciplinas: Biología
Palabras clave: Angiospermas,
Genética,
Plantas comestibles,
Variabilidad genética,
Marcadores moleculares,
Mirabilis expansa,
Nyctaginaceae
Keyword: Biology,
Angiosperms,
Genetics,
Edible plants,
Genetic variability,
Molecular markers,
Mirabilis expansa,
Nyctaginaceae
Texte intégral: Texto completo (Ver PDF)