| Revista: | Computación y Sistemas |
| Base de datos: | PERIÓDICA |
| Número de sistema: | 000457794 |
| ISSN: | 1405-5546 |
| Autores: | Serrano Rubio, Alejandra1 Meneses Viveros, Amilcar1 Morales Luna, Guillermo B1 Paredes Lopez, Mireya2 |
| Instituciones: | 1Instituto Politécnico Nacional, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados, Ciudad de México. México 2Universidad de las Américas Puebla, Departamento de Computación, Electrónica y Mecatrónica, Puebla. México |
| Año: | 2020 |
| Periodo: | Ene-Mar |
| Volumen: | 24 |
| Número: | 1 |
| Paginación: | 255-267 |
| País: | México |
| Idioma: | Inglés |
| Tipo de documento: | Artículo |
| Enfoque: | Aplicado, descriptivo |
| Resumen en inglés | Differential gene expression analysis and clustering techniques have been current tools to study the relation between a gene and biological processes. Since a group of genes may show co-expression under certain conditions, biclustering techniques have been used to find sets of genes sharing similar expression patterns. We present an analysis of the performance of the BIMAX: Binary Inclusion-MAXimal sequential biclustering algorithm. Its performance is evaluated using synthetic datasets. Finally, we propose a strategy of parallelization for optimizing the performance of the BIMAX using parallel programming techniques |
| Disciplinas: | Ciencias de la computación |
| Palabras clave: | Procesamiento de datos, Programación, Algoritmos, Binarios, Agrupación, Expresión génica, Computación de alto rendimiento, Paralelismo |
| Keyword: | Data processing, Programming, Algorithms, Binary, Clustering, Gene expression, High performance computing, Parallelism |
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