Genetic variability within Fusarium solani specie as revealed by PCR-fingerprinting based on PCR markers



Título del documento: Genetic variability within Fusarium solani specie as revealed by PCR-fingerprinting based on PCR markers
Revue: Brazilian journal of microbiology
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000291074
ISSN: 1517-8382
Autores: 1
2
3
Instituciones: 1Universidade Federal de Pernambuco, Departamento de Micologia, Recife, Pernambuco. Brasil
2Universidade Federal Rural de Pernambuco, Departamento de Engenharia de Pesca, Recife, Pernambuco. Brasil
3Universidade Federal de Pernambuco, Departamento de Genetica, Recife, Pernambuco. Brasil
Año:
Periodo: Jul-Sep
Volumen: 35
Número: 3
Paginación: 205-210
País: Brasil
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Artículo
Enfoque: Experimental
Resumen en inglés Fusarium solani fungus (teleomorph Haematonectria haematococca) is of relevance for agriculture, producing a disease that causes significant losses for many cultivars. Moreover, F. solani is an opportunistic pathogen to animals and humans. The complexity associated to its correct identification by traditional methods justifies the efforts of using molecular markers for isolates characterization. In this work, three PCR-based methods (one PCR-ribotyping and two PCR-fingerprinting) were used to investigate the molecular variability of eighteen F. solani isolates from four Brazilian States, collected from different substrates. Genetic analysis revealed the intraspecific variability within the F. solani isolates, without any correlation to their geographical origin and substrate. Its polymorphism was observed even in the very conserved sequence of rDNA locus, and the SPAR marker (GTG)5 showed the highest polymorphism. Together, those results may contribute to understand the relation between fungal genetic variability and cultivars resistance phenotypes to fungal-caused diseases, helping plant-breeding programs
Resumen en portugués O fungo Fusarium solani (teleomorfo Haematonectria haematococca) apresenta uma expressiva importância na agricultura por ser considerado patógeno para várias culturas de interesse econômico causando doença conhecida por podridão das raízes, além de ser patógeno aos animais e ao homem, provocando nestes últimos, micoses superficiais e sistêmicas. A complexidade associada a sua identificação correta através de métodos tradicionais justifica os esforços de usar marcadores moleculares para caracterização dos isolados. Neste trabalho, três métodos baseados na tecnologia da PCR (um por ribotipagem por PCR e dois por impressão genética por PCR) foram utilizados para investigar a variabilidade molecular de dezoito isolados de F. solani de quatro Estados brasileiros, coletados de diferentes substratos. A análise genética revelou a variabilidade intraespecífica dos isolados de F. solani, sem qualquer correlação para a origem geográfica e substrato. Seu polimorfismo foi observado até mesmo na seqüência conservada do locus do rDNA, e o marcador SPAR (GTG)5 mostrou o mais alto polimorfismo. Em conjunto, estes resultados poderão auxiliar nos estudos da relação entre variabilidade do perfil genético de isolados e os fenótipos de resistência de determinados cultivares às doenças provocadas pelo fungo, orientando programas de melhoramento vegetal
Disciplinas: Biología
Palabras clave: Genética,
Hongos,
Parasitología,
Fusarium solani,
Microsatélites,
Variabilidad genética,
ADN ribosomal,
PCR
Keyword: Biology,
Fungi,
Genetics,
Parasitology,
Fusarium solani,
Microsatellites,
PCR,
Ribosomal DNA,
Genetic variability
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