Caracterização molecular de isolados de Flavobacterium columnare de tilapia do nilo e piracanjuba por meio de RAPD-PCR



Título del documento: Caracterização molecular de isolados de Flavobacterium columnare de tilapia do nilo e piracanjuba por meio de RAPD-PCR
Revue: Boletim do Instituto de Pesca
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000390471
ISSN: 0046-9939
Autores: 1
2
1
Instituciones: 1Universidade Estadual Paulista "Julio de Mesquita Filho", Faculdade de Ciencias Agrarias e Veterinarias, Jaboticabal, Sao Paulo. Brasil
2Universidade Estadual Paulista "Julio de Mesquita Filho", Centro de Aquicultura, Jaboticabal, Sao Paulo. Brasil
Año:
Periodo: Oct-Dic
Volumen: 36
Número: 4
Paginación: 325-331
País: Brasil
Idioma: Portugués
Tipo de documento: Nota breve o noticia
Enfoque: Analítico, descriptivo
Resumen en inglés Flavobacterium columnare is a cosmopolite bacteria and it is one of the main problem in Brazilian aquaculture, causing high mortalities index and economic damage. The main factors that contribute to columnaris disease are inadequate water quality, excess handling, high density of fish and temperature variations. For a successful epidemiological study and disease control, it is essential to differentiate the F. columnare from other yellow pigmentation bacteria. The present study used molecular techniques to characterize, by RAPD-PCR, two strains of F. columnare isolated from Oreochromis niloticus and Brycon orbignyanus. Data were analyzed as binary (0 and 1) and a genetic similarity matrix was generated by Jaccard's coefficient. Cluster analysis was performed by the neighbor joining method. The RAPD-PCR technique confirmed to be a usefull tool to obtain genetic profiles from F. columnare isolates based on the oligonucleotides used and to verify genetic similarity
Resumen en portugués Flavobacterium columnare é uma bactéria cosmopolita, agente etiológico da columnariose e considerado um dos maiores problemas na aquicultura brasileira, provocando elevadas taxas de mortalidade e grande prejuízo econômico. Qualidade de água inadequada, manejo zootécnico excessivo, alta densidade de estocagem e variações na temperatura da água são os principais fatores que contribuem para a ocorrência da columnariose. Para a realização de um estudo epidemiológico de sucesso e controle desta enfermidade, é essencial a distinção da F. columnare das demais bactérias de pigmentação amarelada. Para tanto, o objetivo do presente trabalho foi caracterizar molecularmente, por meio da técnica de RAPD-PCR, duas cepas de F. columnare isoladas de Oreochromis niloticus e Brycon orbignyanus. Os dados foram analisados como binários (0 e 1) e uma matriz de similaridade genética foi gerada pelo coeficiente de Jaccard. A análise de agrupamento foi realizada pelo método neighbor joining. A técnica de RAPD-PCR confirmou ser uma ferramenta importante para obtenção do perfil genético dos isolados de F. columnare a partir dos oligonucleotídeos utilizados e para verificação da similaridade genética
Disciplinas: Biología,
Medicina veterinaria y zootecnia
Palabras clave: Bacterias,
Genética,
Medicina veterinaria,
Pesca,
Flavobacterium columnare,
Oreochromis niloticus,
Brycon orbignyanus,
Biología molecular
Keyword: Biology,
Veterinary medicine and animal husbandry,
Bacteria,
Genetics,
Fisheries,
Veterinary medicine,
Flavobacterium columnare,
Oreochromis niloticus,
Brycon orbignyanus,
Molecular biology
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