RNA-Seq: A glance at technologies and methodologies



Título del documento: RNA-Seq: A glance at technologies and methodologies
Revue: Acta biológica colombiana
Base de datos: PERIÓDICA
Número de sistema: 000389214
ISSN: 0120-548X
Autores: 1
2
2
Instituciones: 1Corporación Centro de Investigación en Palma de Aceite, Bogotá. Colombia
2Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias, Bogotá. Colombia
Año:
Periodo: May-Ago
Volumen: 20
Número: 2
Paginación: 23-35
País: Colombia
Idioma: Inglés
Tipo de documento: Ensayo
Enfoque: Descriptivo
Resumen en español En los últimos años, la técnica RNA-Seq ha tenido un desarrollo acelerado y se ha convertido en el método de elección para el estudio y la caracterización de los transcriptomas dinámicos, aprovechando las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento. Estudios aplicando RNA-Seq han mostrado la magnitud, noción y complejidad del transcripotma. A partir de 2008, año de introducción de la técnica, los estudios con RNA-Seq se han multiplicados por más de 2822 veces sólo en 6 años. Al compararse con otros métodos, los estudios empleando RNA-Seq contribuyen a una estimación más precisa de la expresión génica y de las isoformas de los transcriptos. Además, algunas de las aplicaciones potenciales de RNA-Seq no se pueden llevar a cabo con otros métodos. El uso de RNA-Seq aumenta la velocidad de obtención de información y disminuye los costos, logrando con su uso, que investigaciones diversas se vuelvan más frecuentes y precisas. RNA-Seq es un método interdisciplinario que interconecta la biología a otros temas científicos. En este artículo se describe el planteamiento de la tecnología RNA-Seq, metodologías y los métodos realizados en la caracterización de transcriptomas
Resumen en inglés RNA Sequencing (RNA-Seq) is a newly born tool that has revolutionized the post-genomic era. The data produced by RNA-Seq, sequencing technologies and use of bioinformatics are exploding rapidly. In recent years, RNA-Seq has been the method of choice for profiling dynamic transcriptome taking advantage of high throughput sequencing technologies. RNA-Seq studies have shown the transcriptome magnitude, notion and complexity. From 2008, as its introduction year, the relevant reports on RNA-Seq have been multiplied by more than 2822 times just in 6 years. RNA-Seq also contributes a more accurate gene expression and transcript isoform estimation than other methods. Furthermore, some of the potential applications for RNA-Seq cannot be conducted by other methods and as yet are unique to RNA-Seq. As RNA-Seq approaches increase in speed and decrease in cost, more distinct researches are applied and become more common and accurate. RNA-Seq is a cross and interdisciplinary method that interconnects biology to other scientific topics. This article describes RNA-Seq approach, technologies, methodologies, implementation, and methods done so far in characterizing and profiling transcriptomes
Disciplinas: Biología,
Ciencia y tecnología
Palabras clave: Genética,
Ciencias exactas,
Tecnología,
ARN,
Secuenciación,
Transcriptoma,
Expresión génica
Keyword: Biology,
Science and technology,
Genetics,
Exact sciences,
Technology,
RNA,
Sequencing,
Transcriptome,
Gene expression
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