| Journal: | Salud Pública de México |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000430774 |
| ISSN: | 0036-3634 |
| Authors: | Martínez Romero, Esperanza1 Rodríguez Medina, Nadia2 Beltrán Rojel, Marilu2 Silva Sánchez, Jesús2 Barrios Camacho, Humberto2 Pérez Rueda, Ernesto3 Garza Ramos, Ulises2 |
| Institutions: | 1Universidad Nacional Autónoma de México, Centro de Ciencias Genómicas, Cuernavaca, Morelos. México 2Instituto Nacional de Salud Pública, Centro de Investigación sobre Enfermedades Infecciosas, Cuernavaca, Morelos. México 3Universidad Nacional Autónoma de México, Instituto de Biotecnología, Cuernavaca, Morelos. México |
| Year: | 2018 |
| Season: | Ene-Feb |
| Volumen: | 60 |
| Number: | 1 |
| Country: | México |
| Language: | Inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Analítico, descriptivo |
| Spanish abstract | Objetivo: Identificar genomas mal clasificados de K. variicola, y K. quasipneumoniae en la base de datos del GenBank. Material y métodos: En el presente estudio se usaron tanto análisis filogenéticos usando rpoB como la identidad media de nucleótidos (ANI, por sus siglas en ingles) para identificar un número significativo de genomas del género Klebsiella. Resultados: Se reportó una actualización de genomas de K. variicola y K. quasipneumoniae correctamente clasificados y una lista de aquellos aislamientos obtenidos de seres humanos, plantas, animales e insectos, descritos originalmente como K. pneumoniae o K. variicola pero ahora se conoce que están mal clasificados. Conclusiones: Este trabajo contribuye a la presencia extensiva de aislamientos de K. variicola y K. quasipneumoniae en diversos sitios y muestras |
| English abstract | Objective: Due to the fact that K. variicola, K. quasipneumoniae and K. pneumoniae are closely related bacterial species, misclassification can occur due to mistakes either in normal biochemical tests or during submission to public databases. The objective of this work was to identify K. variicola and K. quasipneumoniae genomes misclassified in GenBank database. Materials and methods: Both rpoB phylogenies and average nucleotide identity (ANI) were used to identify a significant number of misclassified Klebsiella spp. genomes. Results: Here we report an update of K. variicola and K. Quasipneumoniae genomes correctly classified and a list of isolated genomes obtained from humans, plants, animals and insects, described originally as K. pneumoniae or K. variicola, but known now to be misclassified. Conclusions: This work contributes to recognize the extensive presence of K. variicola and K. quasipneumoniae isolates in diverse sites and samples |
| Disciplines: | Medicina |
| Keyword: | Bacterias, Genética, Análisis genómico, Clasificación genómica, Infecciones bacterianas, Bacterias Gram negativas, Fijación del nitrógeno, Klebsiella variicola, Klebsiella quasipneumoniae |
| Keyword: | Bacteria, Genetics, Genomic analysis, Genomic classification, Bacterial infections, Gram negative bacteria, Nitrogen fixation, Klebsiella variicola, Klebsiella quasipneumoniae |
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