| Journal: | Revista mexicana de oftalmología |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000458077 |
| ISSN: | 0187-4519 |
| Authors: | Zavala, Judith1 Treviño, Víctor1 Reyna Fuentes, Arely A1 Arellano Gurrola, Clarissa M1 Enriquez Ochoa, Daniela1 Domene Hickman, Jorge L1 Valdez García, Jorge E1 |
| Institutions: | 1Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey, Escuela de Medicina y Ciencias de la Salud, Monterrey, Nuevo León. México |
| Year: | 2019 |
| Season: | Ene-Mar |
| Volumen: | 93 |
| Number: | 1 |
| Pages: | 7-13 |
| Country: | México |
| Language: | Español |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, aplicado |
| Spanish abstract | Propósito: Comparar el nivel de expresión génica asociada al metabolismo de lípidos y colesterol en fibroblastos de pterigión, adipocitos y otros tipos de fibroblastos. Metodología: Los datos de expresión génica de 12 muestras de pterigión primario, 12 de células adiposas y 63 de otros tipos de fibroblastos con la misma plataforma fueron obtenidos de la base de datos Gene Expression Omnibus (GEO). El promedio de expresión para cada gen fue calculado para cada tipo de célula. Los genes diferencialmente y los similarmente expresados se sometieron a análisis de sobrerrepresentación para obtener vías de señalización, interacciones proteicas y términos funcionales asociados. Resultados: De los 16,511 genes analizados se obtuvieron 921 diferencialmente expresados y 1,207 similarmente expresados. Del análisis de sobrerrepresentación de los genes diferencialmente expresados se encontraron 460 genes asociados (p < 0.05) a la proteína SREBP1, mientras que en los genes similarmente expresados se encontraron 615 genes asociados a la misma proteína. Los genes HMGCR, ACOX1 y LRP1 mostraron expresión significativamente disminuida (p < 0.05) en fibroblastos de pterigión en comparación con adipocitos y otros tipos de fibroblastos. La expresión del gen HMGCS fue significativamente mayor (p < 0.05) en fibroblastos de pterigión que en adipocitos y menor que en otro tipo de fibroblastos. Otros genes, incluidos LPL, ACAT1, LSS, LDLR y LCAT mostraron diferencia de expresión entre los tres tipos celulares. Conclusión: La expresión desregulada de genes asociados al metabolismo de lípidos y colesterol en fibroblastos de pterigión está relacionada con la proliferación, sugiriendo su estudio posterior como posibles blancos terapéuticos |
| English abstract | Purpose: To compare the gene expression associated with lipid and cholesterol metabolism in pterygium fibroblasts, adipocytes and other types of fibroblasts. Methodology: Gene expression data from 12 samples of primary pterygium, 12 from adipose cells and 63 from other types of fibroblasts with the same platform were obtained from the gene expression omnibus database. The mean expression for each gene was calculated for each cell type. Differentially and similarly expressed genes were subjected to overrepresentation analysis to obtain signaling pathways, protein interactions, and associated functional terms. Results: Of the 16,511 genes analyzed, 921 differentially and 1,207 similarly expressed were found. From the overrepresentation analysis of differentially expressed genes, 460 genes were found associated (p < 0.05) to the SREBP1 protein, while in the similarly expressed genes 615 were found associated to the same protein. The HMGCR, ACOX1 and LRP1 genes showed significantly decreased expression (p < 0.05) in pterygium fibroblasts compared to adipocytes and other types of fibroblasts. Expression of the HMGCS gene was significantly higher (p < 0.05) in pterygium fibroblasts than in adipocytes and lower than in other fibroblast types. Other genes, including LPL, ACAT1, LSS, LDLR and LCAT showed a differential expression between the three cell types. Conclusion: Deregulated expression of genes associated with lipid and cholesterol metabolism in pterygium fibroblasts is related to proliferation, suggesting further study as potential therapeutic targets |
| Disciplines: | Medicina |
| Keyword: | Oftalmología, Genética, Pterigión, Adipocitos, Microarreglos genéticos, Colesterol, Lípidos, Fibroblastos |
| Keyword: | Ophthalmology, Genetics, Pterygium, Adipocytes, Genetic microarrays, Cholesterol, Lipids, Fibroblasts |
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