| Journal: | Revista mexicana de micología |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000391254 |
| ISSN: | 0187-3180 |
| Authors: | Alanis Martínez, Iobana1 Medina Mendoza, Carmen2 Marbán Mendoza, Nahum1 Valadez Moctezuma, Ernestina2 |
| Institutions: | 1Universidad Autónoma Chapingo, Departamento de Parasitología Agrícola, Chapingo, Estado de México. México 2Universidad Autónoma Chapingo, Departamento de Fitotecnia, Chapingo, Estado de México. México |
| Year: | 2015 |
| Season: | Dic |
| Volumen: | 42 |
| Country: | México |
| Language: | Español |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, analítico |
| Spanish abstract | La caracterización y diferenciación de formas especiales de Fusarium oxysporum mediante análisis de polimorfismos genéticos es más apropiado que solo considerar caracteres morfológicos o fisiológicos. Actualmente se han desarrollado técnicas moleculares sofisticadas para estimar variación genética, diferenciar o identificar microorganismos, tales como las basadas en secuenciación de segunda generación, pero éstas aún tienen altos costos y no son accesibles para muchos laboratorios que requieren diagnosticar o diferenciar a un determinado fitopatógeno. En este trabajo se compararon tres técnicas moleculares clásicas: RAPD, MP-PCR y RAMPnr con la finalidad de diferenciar aislamientos de F. oxysporum f. sp. ciceris, F. oxysporum f. sp. lycopersici, F. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici y F. oxysporum f. sp coffeae. Estas técnicas detectaron polimorfismos entre las formas especiales de Fusarium e incluso entre los genotipos de F. o. f. sp. lycopersici. Los agrupamientos representados en los dendrogramas, indican que F. oxysporum es muy diverso y que las formas especiales analizadas son genéticamente diferentes. Estas técnicas proporcionan un procedimiento simple, rápido y de bajo costo para la caracterización y posterior identificación rutinaria de patógenos |
| English abstract | The characterization and differentiation of special forms of Fusarium oxysporum by analysis of DNA polymorphisms are more appropriate than just considering morphological or physiological characteristics. Currently, they have developed sophisticated molecular techniques to estimate genetic variation, differentiate or identify microorganisms, such as those based on second-generation sequencing, but they still have high costs and are not accessible to many laboratories that require diagnose or differentiate a particular plant pathogen. In this paper, three classical molecular techniques were compared: RAPD, MP-PCR and RAMPnr in order to differentiate isolates of F. oxysporum f. sp. ciceris, F. oxysporum f. sp. lycopersici, F. oxysporum f. sp. radicis-lycopersici and F. oxysporum f. sp coffeae. These techniques detected polymorphisms between the special forms of Fusarium and even between genotypes of F. o f. sp. lycopersici. The groups represented in dendrograms indicate that F. oxysporum is very diverse and that special forms analyzed are genetically different. These techniques provide a simple, fast and inexpensive routine procedure for the characterization and subsequent pathogen's identification |
| Disciplines: | Biología |
| Keyword: | Genética, Hongos, Fusarium oxysporum, Técnicas moleculares, Hongos patógenos, MP, Polimorfismo, RAPD, PCR |
| Keyword: | Biology, Fungi, Genetics, Fusarium oxysporum, Molecular techniques, Pathogenic fungi, MP, PCR, RAPD, Polymorphism |
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