Detección, identificación e inferencia filogenética del nematodo del tallo Ditylenchus dipsaci (Kuhn) filipjev (Nematoda:Anguinidae) afectando alfalfa Medicago sativa L. en Jalisco, México



Document title: Detección, identificación e inferencia filogenética del nematodo del tallo Ditylenchus dipsaci (Kuhn) filipjev (Nematoda:Anguinidae) afectando alfalfa Medicago sativa L. en Jalisco, México
Journal: Revista mexicana de fitopatología
Database: PERIÓDICA
System number: 000413929
ISSN: 0185-3309
Authors: 1
2
3
3
4
Institutions: 1Colegio de Postgraduados, Campus Montecillo, Montecillo, Estado de México. México
2Centro Nacional de Metrología, El Marqués, Querétaro. México
3Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria, Dirección General de Sanidad Vegetal, México, Distrito Federal. México
4Universidad Autónoma Metropolitana, Departamento de Producción Agrícola y Animal, Ciudad de México. México
Year:
Season: Sep
Volumen: 35
Number: 3
Pages: 377-396
Country: México
Language: Español, inglés
Document type: Artículo
Approach: Experimental, aplicado
Spanish abstract El monitoreo de plagas y enfermedades reglamentadas que afectan a los cultivos en México es importante para determinar su presencia e impacto. Con la finalidad de colaborar con las actividades del Sistema Nacional de Vigilancia Epidemiológica Fitosanitaria, se analizaron plantas de alfalfa de Atoyac, Jalisco con acortamiento de entrenudos, deformación de brotes, hojas y decoloración de foliolos, síntomas sospechosos a infestaciones por nematodos foliares. Se analizaron por separado raíces, hojas + brotes y tallos. Se realizó la taxonomía tradicional, análisis molecular y filogenético de dos marcadores del ADN ribosomal de los nematodos detectados. Se aislaron especímenes del género Ditylenchus solo en hojas + brotes y tallos. La identidad de la especie según la morfotaxonomía de hembras y machos correspondió al nematodo del tallo D. dipsaci. El análisis PCR-RFLP de la región ITS1-5.8S-ITS2 mostró un patrón de restricción de 335, 280, 200 y 132 pb con la enzima RsaI y de 400 y 300 pb con HinfI. La alineación BLAST indicó un 99% de homología con D. dipsaci (E=0.0). La filogenia según el criterio de probabilidades posteriores bayesiano de ambos marcadores ubicó a la población mexicana de alfalfa en el grupo que incluye las poblaciones de D. dipsaci sensu stricto. A nuestro saber, este es el primer reporte de D. dipsaci afectando alfalfa en el occidente de México
English abstract Monitoring regulated pests and diseases that affect crops in Mexico is important to determine its presence and impact. With the purpose of supporting the National Phytosanitary Epidemiological Surveillance System activities, alfalfa plants from Atoyac, Jalisco showing stunting, shortened internodes, buds and leaves deformed as well as change leaf coloration, suspicious symptoms produced by foliar nematodes were analyzed. Roots, leaves + buds and stems tissues were analyzed separately. Classical taxonomy, molecular and phylogenetic analysis of two ribosomal DNA markers were performed on specimens detected. Ditylenchus genus specimens were detected and isolated only in leaves + buds and stems. The species identity based on females and males morphotaxonomy belonged to the stem nematode D. dipsaci. The PCR-RFLP restriction pattern of ITS1-5.8S-ITS2 displayed by RsaI enzyme was 335, 280, 200, and 132 bp, while for the enzyme HinfI the pattern was 400 and 300 bp. The BLASTING aligment showed 99% homology with D. dipsaci (E=0.0). The phylogenetic reconstruction of both markers according the bayesian posterior probabilities criteria placed the alfalfa mexican population within the clade that includes several D. dipsaci sensu stricto populations. To our knowledge, this is the first report of D. dipsaci affecting alfalfa in western Mexico
Disciplines: Agrociencias,
Biología
Keyword: Fitopatología,
Leguminosas,
Helmintos,
Ditylenchus dipsaci,
Nematoda,
Análisis filogenético,
Alfalfa,
Medicago sativa,
Jalisco,
México,
ADN ribosomal
Keyword: Agricultural sciences,
Biology,
Legumes,
Phytopathology,
Helminths,
Ditylenchus dipsaci,
Nematoda,
Phylogenetic analysis,
Alfalfa,
Medicago sativa,
Jalisco,
Ribosomal DNA,
Mexico
Full text: Texto completo (Ver HTML)