Journal: | Revista mexicana de física |
Database: | PERIÓDICA |
System number: | 000417361 |
ISSN: | 0035-001X |
Authors: | Dagdug, L1 Young, L2 |
Institutions: | 1Universidad Autónoma Metropolitana, Iztapalapa, Distrito Federal. México 2National Institutes of Health, Mathematical and Statistical Computing Laboratory, Bethesda, Maryland. Estados Unidos de América |
Year: | 2004 |
Season: | Dic |
Volumen: | 50 |
Number: | 6 |
Pages: | 594-600 |
Country: | México |
Language: | Inglés |
Document type: | Artículo |
Approach: | Analítico, teórico |
Spanish abstract | Se implementan las ideas utilizadas para describir la transición vítrea en vidrios fuertes utilizando el método de la matríz estocástica, dando un marco teórico para el estudio de los cambios configuracionales y la temperatura de desnaturalización del ADN. Nuestro modelo teórico nos permite hacer un estudio sistemático de la temperatura de desnaturalización y de la dependencia de esta temperatura con respecto a la diferencia en la secuencia del ADN. Tomando en cuenta la composición en una cadena, se obtienen resultados analíticos para la fracción de cadena intacta y de la fracción denaturada a una temperatura en particular. El método es aplicable a cadenas largas de ADN como de RNA |
English abstract | We extend the ideas used to describe the glass transition in strong glasses employing the stochastic matrix method, giving a theoretical framework for the study of the configurational changes and the melting temperature of DNA. Our theoretical model enables a systematic study of the melting transition and the melting temperature dependence on the sequence differences in vertical stacking. Taking into account the fractional composition in a single strand, exact analytic results are given for the fraction of bonds intact and denatured at a particular temperature. This method is applicable to long DNA as well as RNA |
Disciplines: | Física y astronomía |
Keyword: | Física, Física médica, ADN, Temperaturas de desnaturalización, Método de la marca estocástica |
Keyword: | Physics, Medical physics, DNA, Melting temperature, Stochastic matrix method |
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