| Journal: | Revista mexicana de ciencias agrícolas |
| Database: | PERIÓDICA |
| System number: | 000426096 |
| ISSN: | 2007-0934 |
| Authors: | Bermúdez Guzmán, Manuel de Jesús1 Guzmán González, Salvador2 Orozco Santos, Mario1 Velázquez Monreal, José Joaquín1 Buenrostro Nava, Marco Tulio2 Michel López, Claudia Yared3 |
| Institutions: | 1Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias, Campo Experimental Tecomán, Tecomán, Colima. México 2Universidad de Colima, Facultad de Ciencias Biológicas y Agropecuarias, Colima. México 3Universidad Autónoma de Baja California, Instituto de Ciencias Agrícolas, Ensenada, Baja California. México |
| Year: | 2016 |
| Season: | May-Jun |
| Volumen: | 7 |
| Number: | 4 |
| Pages: | 897-910 |
| Country: | México |
| Language: | Español, inglés |
| Document type: | Artículo |
| Approach: | Experimental, analítico |
| Spanish abstract | La extracción de DNA libre de polisacáridos, polifenoles, proteínas y RNA de plantas constituye el paso inicial para diversos estudios en Biología molecular. Existen diversos métodos de extracción de DNA específicos para caña de azúcar (Saccharum off icinarum), sin embargo, consumen mucho tiempo y utilizan reactivos y equipos costosos. El objetivo del presente estudio fue optimizar un protocolo rápido, eficiente y debajo costo para extraer DNA de hojas de S. officinarum. Las variables evaluadas fueron rendimiento, pureza, integridad y funcionalidad del DNA purificado de hojas de caña de azúcar de 6 meses de edad. Se utilizaron técnicas de espectrofotometría, electroforesis en geles de agarosa y marcadores moleculares para evaluar las variables anteriores. Las variables rendimiento (mg/g) y pureza (A260:280 y A260:230) del DNA extraído mostraron diferencias altamente significativas (p˃ 0.05) con el protocolo I. Los mejores resultados se obtuvieron con la interacción del protocolo I +N2, con un rendimiento de DNA de 1.17 mg/g y purezas de 1.95 y 1.91 (A260:280 y A260:230). La funcionalidad del DNA por amplificación por PCR con los marcadores RAPD y TRAP generaron perfiles de bandas nítidas de buena calidad y de fácil interpretación. Se recomienda el uso del protocolo I +N2 para la extracción de DNA de S. officinarum para obtener elevados rendimientos de DNA con calidad y pureza óptima para aplicaciones de marcadores moleculares |
| English abstract | The DNA extraction free polysaccharides, polyphenols, plant protein and RNA is the initial step to several studies in molecular biology. There are various methods of extracting specific DNA of sugar cane (Saccharum officinarum), however, are time consuming and expensive equipment and reagents used. The aim of this study was to optimize a fast, efficient and inexpensive protocol for extracting DNA from leaves of S. officinarum. The variables evaluated were yield, purity, integrity and functionality of DNA purified from leaves of sugarcane 6 months old. Techniques spectrophotometry, agarose gel electrophoresis and molecular markers to evaluate the above variables were used. The performance variables (mg/g) and purity (A260:280 and A260:230) the extracted DNA showed highly significant differences (p˃ 0.05) protocol I. The best results were obtained with the protocol interaction I +N2, DNA yield 1.17 mg/g and 1.95 and 1.91 purities (A260:280 and A260:230). Functionality DNA by PCR amplification with the RAPD markers and TRAP bands sharp profiles generated good quality and easy to interpret. The use of the protocol I+N2 for extracting DNA from S. officinarum to obtain high yields of DNA with optimal quality and purity for applications of molecular markers is recommended |
| Disciplines: | Agrociencias, Biología |
| Keyword: | Gramíneas, Genética, Saccharum officinarum, Caña de azúcar, Hojas, ADN, Nitrógeno líquido, Marcadores moleculares |
| Keyword: | Gramineae, Genetics, Sugar cane, Saccharum officinarum, Leaves, Liquid nitrogen, Molecular markers, DNA |
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